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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002482`

染色体: Chr05 坐标: 27404053-27410076 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002482`
名称	SmilChr05G002482
描述	copper-transporting ATPase RAN1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27404053 - 27410076 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026254`
GeneID	`131026254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026254`
原始查询	`SmilChr05G002482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper-transporting ATPase RAN1-like
产物	copper-transporting ATPase RAN1-like
Arabidopsis	`AT5G44790` (RAN1) copper-exporting ATPase / responsive-to-antagonist 1 / copper-transporting ATPase (RAN1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834509] identity=73.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0172600` (OsHMA5) - identity=68.6; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0019829 (ATPase-coupled monoatomic cation transmembrane transporter activity)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00122 (E1-E2_ATPase); PF00403 (HMA); PF00702 (Hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057812035.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057812035.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057812035.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057812035.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057812035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27404792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B84,B94
`Chr5:27404873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C48
`Chr5:27405481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:27405488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:27406164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:27407321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:27407900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:27408020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:27408179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B27,B42,B43,D11
`Chr5:27408371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:27408392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:27409622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812035.1

992 aa

496

992

HMA

E1-E2_ATPase

Hydrolase

PF00403 HMA 44-104 aa PF00403 HMA 126-186 aa PF00122 E1-E2_ATPase 444-532 aa PF00702 Hydrolase 641-880 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812035.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	44	104	6.2e-34	116.9	Heavy-metal-associated domain
`XP_057812035.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	126	186	6.2e-34	116.9	Heavy-metal-associated domain
`XP_057812035.1`	Pfam	`PF00122`	E1-E2_ATPase	Domain	444	532	4.5e-23	81.7	P-type ATPase actuator domain
`XP_057812035.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	641	880	3.8e-31	109.7	haloacid dehalogenase-like hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956052.1
TTCTCAAACACCTCGCGCTTACAAATCCGCTCCCTCCCTCCCTCGCTTCCCACCTCAGCCCCTCCTCTCTGTTTCTACATATACAATCATACACTCCATTTTCTATTGGGTTAATAATTATGTTTTAAAATTTCAACGGAAAACTTTACAAACACGATCTCCATCTCTGCATTGTTTTACTCCGCCTGGGATGTCGCTGACTACGATGGGCCTGCAGCTGACTGGCGCCGCCGGAAAAGTGCCGGCGGAGGACGGCGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026254
ATGTCGCTGACTACGATGGGCCTGCAGCTGACTGGCGCCGCCGGAAAAGTGCCGGCGGAGGACGGCGAGGAGGAGAGGTTGCTGAGCGGATTTGATGAAGAGAGCTCAGGGAATCTGTGTAGAATCCAACTCAGCGTGACGGGGATGACCTGTGCAGCGTGCTCAAATTCCGTAGAATCGGCACTGATGAGCCTAAACGGCGTCGTTAAGGCTTCCGTCGCCTTGCTTCAGAACAAGGCGGACGTCACCTTTGATCCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812035.1
MSLTTMGLQLTGAAGKVPAEDGEEERLLSGFDEESSGNLCRIQLSVTGMTCAACSNSVESALMSLNGVVKASVALLQNKADVTFDPALVKDEDIKTAIEDAGFEAEILPEPSQSHSKTHGTLIGQFTIGGMTCAACVNSVEGILRKIPGVRKAVVALATSLGEIEYDPTVTSKDDIINAIEDAGFEASFVQSNEQDKLVLGVIGIASEMDVQMLEGMLCTLRGVRQFCYDRTSKELEIHFDPELLGSRALVDEIESISLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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