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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002486`

染色体: Chr05 坐标: 27530226-27535460 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002486`
名称	SmilChr05G002486
描述	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27530226 - 27535460 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026258`
GeneID	`131026258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026258`
原始查询	`SmilChr05G002486`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase 2-like
产物	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase 2-like
Arabidopsis	`AT2G35020` (GlcNAc1pUT2) N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818066] identity=79.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0206900` (SPL29) - identity=80.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003977 (UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase activity); GO:0006048 (UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01704 (UDPGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812038.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057812038.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27531215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:27533256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:27533448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:27533753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B84,B94
`Chr5:27533774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:27534725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812038.1

485 aa

242

485

UDPGP

PF01704 UDPGP 62-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812038.1`	Pfam	`PF01704`	UDPGP	Family	62	438	6.7e-38	131.2	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102229.1
ACCACTCGTGTCCCAAATCCTTCACTGTTTGGTACATGGGATTAAGTAGCACGTGATTCCCTAAATTACCCTCGACCAATTGCCGGATTTTCAGTAATTCGGCTCGCTTGTAAGGGTTAGTTTCGTCATTGCGCCTCCTTCAAACTGATTCTTCCTTCCTCGCTGCTGCTCTCTCGTATTTAACCACCAAACTGAAACAACACACTCTCTCTCCCCTCTTTCTCTCTCTGTCTCTCTAATTTCTTATATAGACACACTCA...

XM_057956055.1
GTCCATGATTAAACCACATAACCACTCGTGTCCCAAATCCTTCACTGTTTGGTACATGGGATTAAGTAGCACGTGATTCCCTAAATTACCCTCGACCAATTGCCGGATTTTCAGTAATTCGGCTCGCTTGTAAGGGTTAGTTTCGTCATTGCGCCTCCTTCAAACTGATTCTTCCTTCCTCGCTGCTGCTCTCTCGTATTTAACCACCAAACTGAAACAACACACTCTCTCTCCCCTCTTTCTCTCTCTGTCTCTCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026258
ATGAGGGAACCGGCGTCGGAAATTAATGCGCCTTCGCTGCCGCCGCAGTCGTTGCTCGAGAGGGTTAAGGATTACGGACAGGAAGACGTTTTTGCGCTCTGGGACGAGCTCTCTCCCGAAGAGAGAGGCATTCTCGTCAAGGATATCGAGAGCTTAGATCTTCCGAGAGTTGATCGGATTATTCGGTGCTCGTTTCGCTCTCAAGGGCTTCCTGCAGCAGCAATAGAGCCAGTTCCAGAGAGCAATGTTTCGACGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812038.1
MREPASEINAPSLPPQSLLERVKDYGQEDVFALWDELSPEERGILVKDIESLDLPRVDRIIRCSFRSQGLPAAAIEPVPESNVSTVEKRTMEERERWWKMGLKAISDGKLGVLLLSGGQGTRLGSSDPKGCFNIGLPSGKSLFQLQAERILCLQRLAAQSVNEGANIPPIHWYIMTSPFTDEPTRKFFESHKYFGLEADQVTFFQQGTIPCVSRDGRFIMETPYRVAKSPDGNGGVYSALKSSKLLEDMATRGIKYLDCY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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