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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002615`

染色体: Chr05 坐标: 29425548-29426876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002615`
名称	SmilChr05G002615
描述	transcription factor bHLH53-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29425548 - 29426876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026366`
GeneID	`131026366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026366`
原始查询	`SmilChr05G002615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH53-like
产物	transcription factor bHLH53-like
Arabidopsis	`AT1G30670` (AT1G30670) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839947] identity=45; qcov=0.576; evalue=1.93e-21; confidence=medium
Rice	`Os01g0831000` (LAX1) - identity=44.7; qcov=0.313; evalue=1.72e-11; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812213.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812213.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812213.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812213.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29425764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	63	A15,A18,A22,A23,A24,A5,A6,A8,B10,B101,B103,B106,B107,B119,B122,B13,B132,B133,B135,B136,B139,B16,B18,B2,B22,B31,B35,B36,B37,B4,B53,B58,B6,B64,B66,B7,B70,B75,B83,C10,C11,C18,C19,C24,C28,C29,C3,C31,C34,C39,C41,C56,C58,C61,C64,C66,C67,C69,C72,C76,C8,C9,D2
`Chr5:29425887`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B22,B35,B45
`Chr5:29425887`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B22,B35,B45
`Chr5:29426016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B85
`Chr5:29426016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:29426036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:29426041`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B65,C15,C62,C65
`Chr5:29426041`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B65,C15,C62,C65
`Chr5:29426069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C74
`Chr5:29426072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C74
`Chr5:29426118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:29426120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812213.1

262 aa

131

262

HLH

PF00010 HLH 151-195 aa

XP_057812214.1

243 aa

122

243

HLH

PF00010 HLH 132-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812213.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	151	195	1.2e-05	25.7	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057812214.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	132	176	1.1e-05	25.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956231.1
CAAGAATAACCTCCACTCCCACGTTCCTCTCTTTCTCACACACCGCTATTCATAAGCTTTTTTTTGAGTTTGTTAAGGTTTTCTACTGACATTCAAGGCTAGTAGTTAAAAGACACAATCTTTCTTCAGGTAATCCCTTCTTCATCAATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGTTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTT...

XM_057956230.1
TCTCTTTCATTATCTTCTTTAACTTCAATTCTCCGTCCTCAATGCTTATGCTTCTAACACTTGAGATATCGATTTCACAGGTAATCCCTTCTTCATCAATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGTTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTTCTGCAACTCTCTTCTCTGCGACGATCTCACTTATCATGCTAATGGACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026366
ATGCTTATGCTTCTAACACTTGAGATATCGATTTCACAGGTAATCCCTTCTTCATCAATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGTTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTTCTGCAACTCTCTTCTCTGCGACGATCTCACTTATCATGCTAATGGACTTCCCTTGGAATTGGATAATCTCACAACTGCAACCCAACCCCC...

LOC131026366
ATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGTTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTTCTGCAACTCTCTTCTCTGCGACGATCTCACTTATCATGCTAATGGACTTCCCTTGGAATTGGATAATCTCACAACTGCAACCCAACCCCCACCCTTTCTATTGCCGCACCAACAACAACAATCCCAGGCGCCCTTGTTCCACTTCCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812213.1
MLMLLTLEISISQVIPSSSMALSYYSNWTSFQQPDYSGDDPELQSLLNPDDYFADSFCNSLLCDDLTYHANGLPLELDNLTTATQPPPFLLPHQQQQSQAPLFHFPNRHKLYDYSLPEFVLPPPLPQFPAADFSTRICENAKNETSLSAQSIAARQRRRKITVKTQELGKLVPGGHRMNTAEMLQSAYNYVKFLQAQVALLEFLGSHHQEVPFEGEEELQNLLESPLIQEKLYSTQHCLLPNKLAEQVPLLKSNPHLLEK...

XP_057812214.1
MALSYYSNWTSFQQPDYSGDDPELQSLLNPDDYFADSFCNSLLCDDLTYHANGLPLELDNLTTATQPPPFLLPHQQQQSQAPLFHFPNRHKLYDYSLPEFVLPPPLPQFPAADFSTRICENAKNETSLSAQSIAARQRRRKITVKTQELGKLVPGGHRMNTAEMLQSAYNYVKFLQAQVALLEFLGSHHQEVPFEGEEELQNLLESPLIQEKLYSTQHCLLPNKLAEQVPLLKSNPHLLEKDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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