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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002982`

染色体: Chr05 坐标: 36347825-36350966 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002982`
名称	SmilChr05G002982
描述	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36347825 - 36350966 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987031`
GeneID	`130987031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987031`
原始查询	`SmilChr05G002982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase, mitochondrial
产物	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G53000` (CKS) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841733] identity=80.4; qcov=0.946; evalue=2.67e-171; confidence=high
Rice	`Os05g0561500` - identity=77.2; qcov=1.01; evalue=8.87e-162; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008690 (3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase activity)
KEGG	smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02348 (CTP_transf_3); PF12804 (NTP_transf_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766574.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057766574.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057766574.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766574.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36348325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:36349312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C64,C66
`Chr5:36349313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B119,B84,C77
`Chr5:36349676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766574.1

296 aa

148

296

CTP_transf_3

NTP_transf_3

PF02348 CTP_transf_3 52-264 aa PF12804 NTP_transf_3 61-172 aa

XP_057766575.1

296 aa

148

296

CTP_transf_3

NTP_transf_3

PF02348 CTP_transf_3 52-264 aa PF12804 NTP_transf_3 61-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766574.1`	Pfam	`PF02348`	CTP_transf_3	Family	52	264	5.7e-59	200.3	Cytidylyltransferase
`XP_057766574.1`	Pfam	`PF12804`	NTP_transf_3	Domain	61	172	1.4e-10	42.3	MobA-like NTP transferase domain
`XP_057766575.1`	Pfam	`PF02348`	CTP_transf_3	Family	52	264	5.7e-59	200.3	Cytidylyltransferase
`XP_057766575.1`	Pfam	`PF12804`	NTP_transf_3	Domain	61	172	1.4e-10	42.3	MobA-like NTP transferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910592.1
ATTAGCTTCCTCTCTGTCTCTTTTTTTTTTTTATTAAATACCCAAATAAAGAAAAAACACAATGAAAAAGGGAGAATGAATATTGAAGCAGTGAGTGGTCCTCTCCTCGTGTTAAAAGTTCAAACACTGCCCTAATTCCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAGAATGATTTGGTAATTTAAATAAGATGCGGCGGATCAAAGCTGTTAATTAATGGGTGATGAGTGACTCAAGACAGCAGCTCGCGTGGTGTGGCTCATCTA...

XM_057910591.1
AAAGGGAGAATGAATATTGAAGCAGTGAGTGGTCCTCTCCTCGTGTTAAAAGTTCAAACACTGCCCTAATTCCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAGAATGATTTGGTAATTTAAATAAGATGCGGCGGATCAAAGCTGTTAATTAATGGGTGATGAGTGACTCAAGACAGCAGCTCGCGTGGTGTGGCTCATCTAAATCCGGGCGAGAGAGTAACATACAATCCAAGTCGAGGCGAGAATTTGCTCCCAAATGCCGATGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987031
ATGCCGATGTGCAATCCCTCTTCGTCTTCCACGCCCTCTGCCTCCAGTAAGTCGTGGATTATCCACGGCGTGGCGTTGGGGGCGGCGGCTGCCTTGGCTCTTGGCGCCCATTACATGTATTTTAGGCGATCCGGCAAGTTCCGGAGCCGGGTCGTCGGAATTATACCCGCCCGCTTTGCTTCTTCGCGCTTCCAGGGCAAGCCTCTCGTTAACATCCTCGGCAAGCCCATGATCCAGAGAACATGGGAACGAGCTAAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766574.1
MPMCNPSSSSTPSASSKSWIIHGVALGAAAALALGAHYMYFRRSGKFRSRVVGIIPARFASSRFQGKPLVNILGKPMIQRTWERAKMATSLDHIVVATDDEKIADCCRGFGADVVMTSESCRNGTERCNEALSKLDKQYDVVVNIQGDEPLIEPEIIDGIVKALQVAPDAVFSTAVTSLKPEDAHDPNRVKCVVDNHGYAIYFSRGLIPFNKSGNVNPEFPYLLHLGIQSYDTKFLNIYPELPPTPLQLEEDLEQLKVLE...

XP_057766575.1
MPMCNPSSSSTPSASSKSWIIHGVALGAAAALALGAHYMYFRRSGKFRSRVVGIIPARFASSRFQGKPLVNILGKPMIQRTWERAKMATSLDHIVVATDDEKIADCCRGFGADVVMTSESCRNGTERCNEALSKLDKQYDVVVNIQGDEPLIEPEIIDGIVKALQVAPDAVFSTAVTSLKPEDAHDPNRVKCVVDNHGYAIYFSRGLIPFNKSGNVNPEFPYLLHLGIQSYDTKFLNIYPELPPTPLQLEEDLEQLKVLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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