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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002992`

染色体: Chr05 坐标: 36646718-36659271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002992`
名称	SmilChr05G002992
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36646718 - 36659271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987026`
GeneID	`130987026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987026`
原始查询	`SmilChr05G002992`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
产物	cyclic nucleotide-gated ion channel 4-like
Arabidopsis	`AT5G54250` (CNGC4) cyclic nucleotide-gated cation channel 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835513] identity=75.2; qcov=0.919; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0502000` (OsCNGC9) - identity=66.5; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00027 (cNMP_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766569.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766569.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766569.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766569.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36646746`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr5:36646746`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr5:36646923`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:36646923`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:36646949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C64,C66
`Chr5:36647000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:36655869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:36655899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B139,C35,C4
`Chr5:36657844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,D6
`Chr5:36657861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:36657886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B75
`Chr5:36658024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766569.1

690 aa

345

690

cNMP_binding

PF00027 cNMP_binding 514-601 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766569.1`	Pfam	`PF00027`	cNMP_binding	Domain	514	601	4.6e-07	30.4	Cyclic nucleotide-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910586.1
AATGAGTTCAGACACAACGCACTTTGTCTCACCACTCACCAACCAGCCTAGTATTAATTCCTTTTCCCTAATCCCAACAGATTCAATTAACGAAATTCTCCCAAGGAGAAAATCAATTATCATGCCGAATTGCGAGCAAGAAGGCCTCCGCTACAACTACAGCAATGACGACAGTGATTCCGACGAGGCGGAGGGGGAGGAGGAGGTAACTAATCCGGCGAGGTCCGAGGGCGGTTGCGGATTCCGGCGGCGCTGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987026
ATGAGTTCAGACACAACGCACTTTGTCTCACCACTCACCAACCAGCCTAGTATTAATTCCTTTTCCCTAATCCCAACAGATTCAATTAACGAAATTCTCCCAAGGAGAAAATCAATTATCATGCCGAATTGCGAGCAAGAAGGCCTCCGCTACAACTACAGCAATGACGACAGTGATTCCGACGAGGCGGAGGGGGAGGAGGAGGTAACTAATCCGGCGAGGTCCGAGGGCGGTTGCGGATTCCGGCGGCGCTGGTGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766569.1
MSSDTTHFVSPLTNQPSINSFSLIPTDSINEILPRRKSIIMPNCEQEGLRYNYSNDDSDSDEAEGEEEVTNPARSEGGCGFRRRWWRLWGKVLDPRATWVQEWNRLFLLVCAVGLFVDPLFFYTLSISESCMCLFVDGWFAVTVTVLRCMIDALHLWNVWLQLKMNRRMHDAATVAFKYFKSRKGFTFDLFVILPLPQIVIWVIIPRLLERGWTTVVMTVLLVMFVFQYLPKIYHSVCLLRRMQNFSGYIFGTVWWGIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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