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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003380`

染色体: Chr05 坐标: 44753637-44759182 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003380`
名称	SmilChr05G003380
描述	uncharacterized SmilChr05G003380
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44753637 - 44759182 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024826`
GeneID	`131024826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024826`
原始查询	`SmilChr05G003380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0258300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0258300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G61670` (AT3G61670) extra-large G-like protein, putative (DUF3133) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825340] identity=35.6; qcov=0.781; evalue=2.48e-98; confidence=medium
Rice	`Os02g0258300` - identity=33.4; qcov=1.02; evalue=3.94e-127; confidence=low
GO	GO:1900150 (regulation of defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF11331 (Zn_ribbon_12); PF22910 (EDR4-like_1st)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810348.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810348.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810348.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810348.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44755219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B33,C75
`Chr5:44755455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,D11,D6
`Chr5:44755546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:44755552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:44755808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B122,B130,B136,C33
`Chr5:44755812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:44755982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B65,B93
`Chr5:44756172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C76
`Chr5:44756352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:44756564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:44756702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:44756733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810348.1

923 aa

462

923

EDR4-like_1st

Zn_ribbon_12

PF22910 EDR4-like_1st 6-39 aa PF11331 Zn_ribbon_12 518-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810348.1`	Pfam	`PF22910`	EDR4-like_1st	Domain	6	39	6.1e-20	71.2	Enhanced disease resistance 4-like, N-terminal domain
`XP_057810348.1`	Pfam	`PF11331`	Zn_ribbon_12	Domain	518	561	3.9e-21	75.3	EDR4 zinc-ribbon domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954365.1
TGCGTGAAAAAGTTAAAACGCAGGCGTTTAACGCCAGTCTGAAAATAGGGATTTGGTTTCTCTAATACAGCTTGCATTTTCCTTTTCCTTTTCCTTTTACTTTTGCCAAAGCAGCTTTCCACAGAGCTCACTGCAACGTCGCCGTTTGGGTCTCTATACACCCCAAACTACGCCGTTTAGCTCGGTCTCTCCCCAGCCTCACAAATTACTGAATGCCATAAAACAATCCAAAATTCTTCAAAAAAGAAAGTTGGAAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024826
ATGGAGGAAGCTTCAAAAGTACGGCTGGTTCGTTGCCCCAAGTGCGAGAATCTCCTTCCGGAGCTCCCTGATTTCTCTCTCTACAAGTGTGGAGGCTGCGGTGCGATTTTGAAAGCTAAAAAGAGGGTGATTGTGGAAGATAGATCGTCGGAGATATCCGAGGATTTAAAGGGTGGAGGAATTTCTGAGGAGAACAGCATAGCTAAAGGAACCAAGGTTGACATAGAAAGTGCTGATGTAATTGAAGACGGCGCAGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810348.1
MEEASKVRLVRCPKCENLLPELPDFSLYKCGGCGAILKAKKRVIVEDRSSEISEDLKGGGISEENSIAKGTKVDIESADVIEDGAVEKIQKEEGLVSNGTSTSPAELKETQADSDTSRRGKERVRNVESSDDEFRPYPQGLIRNRNRGKSCDFRVDGPEFVDFHDDNVKGMPPMDSSRSRPVMDQWGVKSKGSVHGPARGVPAQVRFDDFVYHDEGQSSYGINSYYEQGERTRYRGHNLDRHDSIESLENGRVELLRKLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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