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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003422`

染色体: Chr05 坐标: 45463285-45466768 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003422`
名称	SmilChr05G003422
描述	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45463285 - 45466768 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024513`
GeneID	`131024513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024513`
原始查询	`SmilChr05G003422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1-like
产物	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1-like
Arabidopsis	`AT1G15690` (AVP1) Inorganic H pyrophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838138] identity=87; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0802500` (OVP3) - identity=86.8; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004427 (inorganic diphosphate phosphatase activity); GO:0009678 (diphosphate hydrolysis-driven proton transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF03030 (H_PPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057810002.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057810002.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057810002.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810002.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45464245`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A5
`Chr5:45464245`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A5
`Chr5:45464331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C73
`Chr5:45464378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C14
`Chr5:45464478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:45464480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:45464775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:45464917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:45464924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C14,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810002.1

325 aa

162

325

H_PPase

PF03030 H_PPase 4-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810002.1`	Pfam	`PF03030`	H_PPase	Family	4	313	8.8e-86	289.7	Inorganic H+ pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954019.1
CACCGTTCTCTCCTCTTCCTTTTCTCTTAGCCACCGCCTTACTCCCTTCAAGCCAGGCGGCTACTGTCGCCGCCAGCCCCCATCCTCGCCGCCATTCTCCACCGTCCTCGCCGCCGCGTAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCGCCACCATCCTCGCCGCTGAGGCCCTTTATCCCTTTCTCTTCTGCGAACAGCAGCGGTCCGAGCCGCCACCGCTGATGTATCATTCTCTGAAACTCCGGCGCCGCTTCTGTAAAATCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024513
ATGGTTACTTTTGCAGTCCTCATCTTCCTGTTCCTGGGTTCAGTTGAGGGTTTCAGCACAAGTTTCCGACCTTGTACTTATGATCAGGAGAAGCTTTGCAAGCCTGCTCTTGCAACTGCTATCTCCAGTACAGTTTCCTTCTTGCTTGGTGCCATCACCTCTGTCGTTTCTGGTTTCCTCGGGATGAAAATTGCAACCTATGCAAATGCAAGGACAACATTGGAAGCTAGAAAAGGTGTTGGAAAAGCTTTCATTGTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810002.1
MVTFAVLIFLFLGSVEGFSTSFRPCTYDQEKLCKPALATAISSTVSFLLGAITSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFIVAFRSGAVMGFLLAANGLLVLYITINLFKIYYGDDWEGLFEAITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAEASCAALVVASISSFGITHDFTGMCYPLLISSMAILVCLITTLFATDFFEIKAVKEIEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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