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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003912`

染色体: Chr05 坐标: 52846628-52848308 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003912`
名称	SmilChr05G003912
描述	uncharacterized SmilChr05G003912
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52846628 - 52848308 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024975`
GeneID	`131024975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024975`
原始查询	`SmilChr05G003912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834140]; symbol=AT5G41380; hit=AT5G41380; species=arabidopsis; confidence=low
产物	CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834140]; symbol=AT5G41380; hit=AT5G41380; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41380` (AT5G41380) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834140] identity=74; qcov=0.401; evalue=2.01e-28; confidence=low
Rice	`Os01g0835700` (OsCCT01) - identity=58.9; qcov=0.401; evalue=1.05e-20; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810550.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810550.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810550.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810550.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810550.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52846794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B105,C57,D1
`Chr5:52846823`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A10,A18,A19,A23,A8,B1,B100,B102,B106,B110,B112,B117,B120,B124,B13,B137,B14,B2,B20,B26,B28,B29,B35,B40,B45,B46,B49,B53,B58,B60,B61,B62,B65,B72,B77,B8,B88,B9,B97,B99,C1,C10,C29,C31,C43,C44,C47,C58,C62,C63,C72,C73,C74,C76,C82,C83,D1,D10,D2,D4,D5,D7,D8
`Chr5:52846825`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A10,A18,A19,A23,A8,B1,B100,B102,B106,B110,B112,B117,B120,B124,B13,B137,B14,B2,B20,B26,B28,B29,B35,B40,B45,B46,B49,B53,B58,B60,B61,B62,B65,B72,B77,B8,B88,B9,B97,B99,C1,C10,C29,C31,C43,C44,C47,C58,C62,C63,C72,C73,C74,C76,C82,C83,D1,D10,D2,D4,D5,D7,D8
`Chr5:52846919`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr5:52846919`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr5:52847764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C54,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810550.1

182 aa

182

CCT

PF06203 CCT 119-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810550.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	119	161	1.1e-16	61.3	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954567.1
GCTCCATTCTATAAATTCTGATCTATTTCCATACAAAAACTTCAAGTGAGGAAATCTGGTCTTCACTACTGCGTGTGCTGTGTGTGAGAGAGACAAATACAAATACAAATACAAAAATACAATGTGTTCTGAGGTCTTTGGTTTTGACATAAATTATTTTGTGTACGAAACATCTTCTCCTAAGGCTAAGGCTACTCATGATGAAGATTACCTTTTCTTGGAGAGTAGCTCTTGGGAAGAAATTGCATCTCTTGTGGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024975
ATGTGTTCTGAGGTCTTTGGTTTTGACATAAATTATTTTGTGTACGAAACATCTTCTCCTAAGGCTAAGGCTACTCATGATGAAGATTACCTTTTCTTGGAGAGTAGCTCTTGGGAAGAAATTGCATCTCTTGTGGTGTCTTCATCCGAGCTCAGAGATGCAGTCATGGAGGTGAAGACAGGGGAATCCCACTTCATGCACACCAATTATCATGCCCAAAATCACCAACTTTTTCACTTTGATCGTGTTTGGGACTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810550.1
MCSEVFGFDINYFVYETSSPKAKATHDEDYLFLESSSWEEIASLVVSSSELRDAVMEVKTGESHFMHTNYHAQNHQLFHFDRVWDSKNHFLQVVAPFSSEKSLMEEGNFKVGKYNKEERKWRIDRYRAKRTRRNFNKTIKYACRKTLADGRQRIRGRFARNDEVGEILEASLFQRCEDKYDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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