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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004084`

染色体: Chr05 坐标: 54694122-54696406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004084`
名称	SmilChr05G004084
描述	uncharacterized SmilChr05G004084
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54694122 - 54696406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025145`
GeneID	`131025145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025145`
原始查询	`SmilChr05G004084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577]; symbol=AT1G10380; hit=AT1G10380; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577]; symbol=AT1G10380; hit=AT1G10380; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G10380` (AT1G10380) Putative membrane lipoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837577] identity=40.1; qcov=0.94; evalue=5.69e-56; confidence=medium
Rice	`Os06g0364500` - identity=29.9; qcov=1.05; evalue=5.88e-30; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind); PF14380 (WAK_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810751.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810751.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810751.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810751.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54695307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr5:54695317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:54695318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:54695323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:54695521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:54695581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:54695709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:54695816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B40,B73
`Chr5:54696009`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr5:54696009`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr5:54696011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:54696042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810751.1

302 aa

151

302

GUB_WAK_bind

WAK_assoc

PF13947 GUB_WAK_bind 28-90 aa PF14380 WAK_assoc 225-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810751.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	28	90	2.3e-07	31.8	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057810751.1`	Pfam	`PF14380`	WAK_assoc	Domain	225	260	3.8e-06	28.2	Wall-associated receptor kinase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954768.1
GAGGATTCGAACTACCCATCTATTGATGGAAAGAAAAGCGCGACACATACAAAAATCATGCCTTTGCCATAATAAAACATTCCACAACAAATATTTTGCACACAAAAATACATTTCCAACTTTTCAAAATGAAAAAAATCAACACTACTCACATTCTCCTCATCACACTCCTCTCCATCGCCATCCCTCCCCTCGCCCTCGCCGGCACGTGCCGCGACACGTGCGGCGCGATCCCCATCAAATACCCCTTCGGGTCGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025145
ATGAAAAAAATCAACACTACTCACATTCTCCTCATCACACTCCTCTCCATCGCCATCCCTCCCCTCGCCCTCGCCGGCACGTGCCGCGACACGTGCGGCGCGATCCCCATCAAATACCCCTTCGGGTCGGGCAGCGGCTGCGGGCACCCGTACTTCTCCCGCTACGTGAAGTGCGCCCCCGGCGGTGCCCTCCATCTCTCCACCGCCGCCGCCGGGGGCGCCGCCTACGCCGTCATCTCCTCCATCGACTACGCCGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810751.1
MKKINTTHILLITLLSIAIPPLALAGTCRDTCGAIPIKYPFGSGSGCGHPYFSRYVKCAPGGALHLSTAAAGGAAYAVISSIDYAAGALVAADPLMSTCAAMQDSGGFALDRGSPFSVAADNIFALLGCSATSPVFDPDADFCDTGSGRNVCRGLYTCEGVAGIGLEPHAPVSTCCVYEPPVSDGSGSGLGLDLPKLQCSSYSSVYGFGGNEGDPMRWQYGILLRFNDSYYSSDCRNCEESGGFCGFQGLEESFSCKCRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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