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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004170`

染色体: Chr05 坐标: 55642921-55643908 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004170`
名称	SmilChr05G004170
描述	transcription factor PRE6-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55642921 - 55643908 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025225`
GeneID	`131025225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025225`
原始查询	`SmilChr05G004170`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmbHLH125` P003; 2025	`KP257557.1`	`LOC131025225` `SmilChr05G004170` GeneID 131025225	protein; identity 98.925%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor PRE6-like
产物	transcription factor PRE6-like
Arabidopsis	`AT3G28857` (PRE5) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745895] identity=71; qcov=1.01; evalue=2.78e-38; confidence=medium
Rice	`Os03g0171300` (ILI6) - identity=70.1; qcov=0.837; evalue=1.65e-32; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0040008 (regulation of growth); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23174 (bHLH_ILI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810865.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810865.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810865.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810865.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55643255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:55643343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B4,B7
`Chr5:55643691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810865.1

92 aa

bHLH_ILI

HLH

PF23174 bHLH_ILI 17-91 aa PF00010 HLH 19-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810865.1`	Pfam	`PF23174`	bHLH_ILI	Domain	17	91	6.4e-35	120.1	ILI bHLH domain
`XP_057810865.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	19	59	9.2e-05	22.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954882.1
AGGGCACCGCTTCCTCCCATGCACTTGTCTTCATCTCCTCCAACACAACCACTTTTAGTGTTGCCACAATATCTACTCTCCAAAATCCCACCCCTCACTCTTCCATTACCCCTCTGTCCATAACTTGTCCCTCAACAGTCATCTTTCCCTCCACCATTTAAGCCCCATTTCCCTCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTAACCCTCTGCCTCTCTTTCTCTCTCTTACACACACAACATCCAACAAACACAACAACTAATTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025225
ATGTCTAGCAGAAGATCGCGTTCGAGGGCGTCGGGATCCTCGAGGATAACCGACGATCAGATCGCCGACCTCGTCTCGAAATTGCAGCAACTCATCCCCGAGATCCGCAGCCGCCGTTCCGACAAGGCTTCGGCTTCGAAGGTGTTGCAGGAGACGTGCAACTACATAAGGAACTTGCACAGAGAGGTGGATGATCTGAGCCATCGATTGTCGGGGCTGCTGGAATCGACGGACGGCGACAGCGCTCAAGCCGCCATTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810865.1
MSSRRSRSRASGSSRITDDQIADLVSKLQQLIPEIRSRRSDKASASKVLQETCNYIRNLHREVDDLSHRLSGLLESTDGDSAQAAIIRSLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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