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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004180`

染色体: Chr05 坐标: 55707244-55711464 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004180`
名称	SmilChr05G004180
描述	serine/threonine-protein kinase PBL34-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55707244 - 55711464 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025235`
GeneID	`131025235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025235`
原始查询	`SmilChr05G004180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase PBL34-like
产物	serine/threonine-protein kinase PBL34-like
Arabidopsis	`AT5G15080` (AT5G15080) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831360] identity=74.1; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0588500` (OsRLCK40) - identity=72.5; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810885.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810885.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810885.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810885.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55707558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B115,B48,B94
`Chr5:55707561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B73
`Chr5:55707565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B35,B72,C85
`Chr5:55707612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:55707639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B94,C41
`Chr5:55707648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C86,D10
`Chr5:55707723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B77
`Chr5:55707774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,C43,C64,C66,D7
`Chr5:55707798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,B28
`Chr5:55707819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:55707927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B132,B17,B4,C15
`Chr5:55707966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810885.1

482 aa

241

482

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 126-401 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 127-403 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810885.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	126	401	9.8e-45	153.7	Protein kinase domain
`XP_057810885.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	127	403	1.6e-46	159.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954902.1
ACCGATTATTCACACATTTTTTCTGAAATATACTTTTCCTTTTTTGTTTTCATACATAAATAATTATTTCACACATCACACATCCAAACAACTCGATATCTATTGTGGATGATTACTATATATATTAATTTTCCATTTCTTTTTTTCCACCTTTCAGCAATTGAAGCAGTCAGCATAATTTTGTGTTTTCCGCAGAGATTTTGATACCTTTTTTTTTCAAGGGGAGAGACATTTCTGCGGTGGTGGCACTGTTTTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025235
ATGGGATTAGCTGATGATGGCTTAAAGGTTGAATCTTGGAGCGTTGAGAAATCTAAGGGGAGGAAGAAGAGAGATGATGATGATGATGCGGTGGAGGAGACTGGTTGTTGGATTAAATTGAGGTTTATTGGGAGCTGTATTTCTTCAAGATCTAAAGTTGATAACTCTCTTAGTGGCATCAGCACTCATGAGAGTAAATCTACGAACGGGACTAGTACGGATCAACCAGTTGCCCCGGTAATCCCGTCCACCACCACTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810885.1
MGLADDGLKVESWSVEKSKGRKKRDDDDDAVEETGCWIKLRFIGSCISSRSKVDNSLSGISTHESKSTNGTSTDQPVAPVIPSTTTSNAESNSSSSKLEEELKVSSRLRKFTFIDLKLATRNFRPESLLGEGGFGCVFKGWIEENGTAPVKPGTGLTVAVKTLNHDGLQGHKEWLAEVNFLGDLVHPNLVKLIGYCIEDDQRLLVYEFMPRGSLENHLFRRSLPLPWSIRMKIALGAAKGLAFLHEEAERPVIYRDFKTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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