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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004269`

染色体: Chr05 坐标: 56468369-56473267 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004269`
名称	SmilChr05G004269
描述	AP-1 complex subunit mu-2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	56468369 - 56473267 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025314`
GeneID	`131025314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025314`
原始查询	`SmilChr05G004269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-1 complex subunit mu-2
产物	AP-1 complex subunit mu-2
Arabidopsis	`AT1G60780` (HAP13) Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842372] identity=90.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0703600` (SPL28) - identity=92.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030131 (clathrin adaptor complex); GO:0031410 (cytoplasmic vesicle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub); PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057811026.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057811026.1`
3	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057811026.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057811026.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057811026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:56469948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:56470105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr5:56470107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr5:56470581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:56471554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:56471650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:56471808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:56472036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B84
`Chr5:56472906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811026.1

428 aa

214

428

Clat_adaptor_s

Adap_comp_sub

PF01217 Clat_adaptor_s 7-131 aa PF00928 Adap_comp_sub 159-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811026.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	7	131	2.8e-07	31.3	Clathrin adaptor complex small chain
`XP_057811026.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	159	426	7.2e-96	321.2	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955043.1
TGATTCCACCAATTGGAAATTTCTAACCTTTCGTCATTTTTAGCTGAATTTTGATGGAAAAGGAGAAGAAGATCGAGCTTAAATATTCTCCCAAATCTCTCTCTCACACACTCCGACAGCAATGACGCGGCCATTTCACCCCTCAATTTCCACATAGTTGCGGGATCAGCACCGGATCTCGCCGCCATTGATTCCAGCAACTCGTGATCTGCGGCTCTCGTATGCAATTGGACCGGAGGAAATTGAGTTGGGGGGAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025314
ATGGCGGGAGCAGCATCGGCGCTGTTCCTACTGGACATTAAGGGTAGGGTTCTGGTGTGGCGGGACTACCGCGGAGACGTCTCCGCCTCTCAGGCCGAACGCTTCTTCGCTAAGCTAATGGAGAAAGAGGGTGATCCAGAGACTCAGGATCCTGTTGTTTACGATAATGGTGTGACATACATGTTTATACAACACAACAATGTATATCTCATGACTGCATCTCGGCAGAACTGCAATGCTGCTAGCCTTCTTTTATTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811026.1
MAGAASALFLLDIKGRVLVWRDYRGDVSASQAERFFAKLMEKEGDPETQDPVVYDNGVTYMFIQHNNVYLMTASRQNCNAASLLLFLHRVVDVFKHYFEELEEESLRDNFVVVYELLDEIMDFGYPQYTEAKILSEFIKTDAYRMEVAQRPPMAVTNAVSWRSEGIRYKKNEVFLDVVESVNILVNSNGQIIRSDVVGALKMRTYLSGMPECKLGLNDRVLLEAQGRATKGKAIDLDDIKFHQCVRLARFENDRTISFIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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