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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000057`

染色体: Chr06 坐标: 455272-459376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000057`
名称	SmilChr06G000057
描述	leucine aminopeptidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	455272 - 459376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987602`
GeneID	`130987602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987602`
原始查询	`SmilChr06G000057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine aminopeptidase 1-like
产物	leucine aminopeptidase 1-like
Arabidopsis	`AT2G24200` (LAP1) Cytosol aminopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816954] identity=75.9; qcov=0.912; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0434400` - identity=68.6; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006508 (proteolysis); GO:0030145 (manganese ion binding); GO:0070006 (metalloaminopeptidase activity)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00883 (Peptidase_M17); PF02789 (Peptidase_M17_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767172.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057767172.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057767172.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767172.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:455322`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A18,B118,B52,C39,C70
`Chr6:455322`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A18,B118,B52,C39,C70
`Chr6:455352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B57,B65,B68
`Chr6:455488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C27,C50
`Chr6:455522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:455897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B54,B70,C18
`Chr6:456002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr6:456215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B112,B78,C22,C59
`Chr6:456245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B37
`Chr6:456484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B87,C26
`Chr6:456577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B87,C26
`Chr6:456778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767172.1

577 aa

288

577

Peptidase_M17_N

Peptidase_M17

PF02789 Peptidase_M17_N 91-224 aa PF00883 Peptidase_M17 261-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767172.1`	Pfam	`PF02789`	Peptidase_M17_N	Domain	91	224	5.2e-25	88.5	Cytosol aminopeptidase family, N-terminal domain
`XP_057767172.1`	Pfam	`PF00883`	Peptidase_M17	Domain	261	567	1.7e-113	379.8	Cytosol aminopeptidase family, catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911189.1
CTCGTCGAGAAGAAGACGTGTTCACATTGTATGTATCTTTATATCTATATATGTATCTATCTATATATATCGGCAGAATGGCCACTCTGAGACTAGCATCTGCCGCTTCCTTCACTCTTCTCTCTACTGCCGCTCCTCCTTCTTCCTTCCCCGCCCTTTTCGTCAAATTCACCTTCACACCCATCTCCGCAAAGCGCATGGCTCACTCAATTGCTCGCGCCACTCTCGGCCTCACCCAGCCCAGCAAGATCGACCCACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987602
ATGTATCTATCTATATATATCGGCAGAATGGCCACTCTGAGACTAGCATCTGCCGCTTCCTTCACTCTTCTCTCTACTGCCGCTCCTCCTTCTTCCTTCCCCGCCCTTTTCGTCAAATTCACCTTCACACCCATCTCCGCAAAGCGCATGGCTCACTCAATTGCTCGCGCCACTCTCGGCCTCACCCAGCCCAGCAAGATCGACCCACCTAAGATCTCATTTGCTGCAAAAGATGTTGATTTGGTGGAGTGGAAGGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767172.1
MYLSIYIGRMATLRLASAASFTLLSTAAPPSSFPALFVKFTFTPISAKRMAHSIARATLGLTQPSKIDPPKISFAAKDVDLVEWKGDIVAVGVTEKDLVRDDNSKFKNSLLQKLDSKLGGLLSEVSAEEEFTGKMGQSTVVRLPGLGSKRVGLIGLGSGASAATTYRSLGEALAAAAKAAHATSVAVTLASPEGIPAELKLTTASAIASGAVLGTFDDIRFKSESKQPTLKSVDIIGLGTGSEIEKKLKYAGDVCSGIIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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