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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000147`

染色体: Chr06 坐标: 1023494-1029144 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000147`
名称	SmilChr06G000147
描述	NADPH--cytochrome P450 reductase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1023494 - 1029144 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987690`
GeneID	`130987690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987690`
原始查询	`SmilChr06G000147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADPH--cytochrome P450 reductase-like
产物	NADPH--cytochrome P450 reductase-like
Arabidopsis	`AT4G30210` (ATR2) P450 reductase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829144] identity=71.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0558900` (OsCPR3) - identity=70.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003958 (NADPH-hemoprotein reductase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0010181 (FMN binding); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00175 (NAD_binding_1); PF00258 (Flavodoxin_1); PF00667 (FAD_binding_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057767285.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057767285.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057767285.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767285.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1023917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B81,C42
`Chr6:1024682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr6:1024914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr6:1025326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B12,B32
`Chr6:1025395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B82
`Chr6:1025657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:1025926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B81,C42
`Chr6:1025967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr6:1025970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B81,C42
`Chr6:1026016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B81,C42,C6
`Chr6:1026217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C15
`Chr6:1026389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767285.1

705 aa

352

705

Flavodoxin_1

FAD_binding_1

NAD_binding_1

PF00258 Flavodoxin_1 98-241 aa PF00667 FAD_binding_1 301-522 aa PF00175 NAD_binding_1 559-669 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767285.1`	Pfam	`PF00258`	Flavodoxin_1	Domain	98	241	7.2e-31	108.0	Flavodoxin
`XP_057767285.1`	Pfam	`PF00667`	FAD_binding_1	Domain	301	522	1.5e-69	234.7	FAD binding domain
`XP_057767285.1`	Pfam	`PF00175`	NAD_binding_1	Domain	559	669	2.8e-17	64.1	Oxidoreductase NAD-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911302.1
TATAACCATGGTCAACCGATGTTAGGTGGTCTTAACCATTCTAGCTTCTCCCTCCTTCTCTCTCTACCCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCAACAAAACTCCATTGAACAGCACCTCTCGTCCAATCTGTGGAAGTCAGAGTCCCTCCCAACATATCCCCATTCTCTCAACAAAATCATAAAACCTTAAAACCTGAGGAGGGGGGAGGCTCTGAATAATTTATGCGTATATATGTAGAGAGAGGTTTTTTTTTATTAATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987690
ATGGAACCCTCGTCGAAGAAGCTCTCGCCGCTCGATTTCATAACGGCGATCTTAAAAGGCGATATAGAGGGGGTGGCGCCGCGGGGTGTGGCGGCGATGTTGATGGAGAATAGGGACCTGGCGATGGTGCTTACTACGTCCGTTGCGGTGCTCATAGGCTGCGTCGTGGTGCTGGCCTGGCGGCGCACCGCCGGATCGGCGGGGAAGAAGCAGCTGCAGCCGCCCAAGCTGGTGGTGCCGAAGCCGGCAGCGGAGCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767285.1
MEPSSKKLSPLDFITAILKGDIEGVAPRGVAAMLMENRDLAMVLTTSVAVLIGCVVVLAWRRTAGSAGKKQLQPPKLVVPKPAAEPEEAEDEKTKVSVFFGTQTGTAEGFAKAFAEEAKARYPQAKFKVIDLDDYAADDDEYEEKLKKESLAFFFLASYGDGEPTDNAARFYKWFTEGKDREDWLKNLQYGVFGLGNRQYEHFNKIAIVVDDLITEQGGKKLVPVGLGDDDQCIEDDFSAWRELVWPELDKLLRNEDDAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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