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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000349`

染色体: Chr06 坐标: 2639029-2643595 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000349`
名称	SmilChr06G000349
描述	long chain base biosynthesis protein 2a
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2639029 - 2643595 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987897`
GeneID	`130987897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987897`
原始查询	`SmilChr06G000349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	long chain base biosynthesis protein 2a
产物	long chain base biosynthesis protein 2a
Arabidopsis	`AT5G23670` (LCB2) long chain base2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832432] identity=83.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0516000` (OsLCB2a3) - identity=82.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004758 (serine C-palmitoyltransferase activity); GO:0017059 (serine palmitoyltransferase complex); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0046512 (sphingosine biosynthetic process); GO:0046513 (ceramide biosynthetic process)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF01041 (DegT_DnrJ_EryC1); PF01212 (Beta_elim_lyase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767581.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057767581.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767581.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767581.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767581.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2642430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B137,B86
`Chr6:2643250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,C2,C32,C68
`Chr6:2643289`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr6:2643289`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767581.1

489 aa

244

489

Aminotran_1_2

DegT_DnrJ_EryC1

Beta_elim_lyase

PF00155 Aminotran_1_2 101-460 aa PF01041 DegT_DnrJ_EryC1 149-293 aa PF01212 Beta_elim_lyase 149-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767581.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	101	460	3.8e-54	185.0	Aminotransferase class I and II
`XP_057767581.1`	Pfam	`PF01041`	DegT_DnrJ_EryC1	Domain	149	293	1.9e-06	28.1	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family
`XP_057767581.1`	Pfam	`PF01212`	Beta_elim_lyase	Domain	149	329	2.8e-07	30.9	Beta-eliminating lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911598.1
TTCAAATCAGTGAAAAAGAGGTACGGTCAGAATCAATCTCCTTCCTCTTTTCTTATTTTTCTTCCTCTCTCTCTTACATACTTTTCTCTCTCTATCGGGATCTCAGCCGAGGGGGCTCCGATCCTCTTCTCCTTTCCACGCCGCAGGATCAGATCGCCGCCGCCGTGGATTCCAAGATGATCACAATTCCTTACATCACCGCCCTTACCACATACTTCAGCTACGGCCTCCTCTTCGCATTCGGTCAGCTCCGCGATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987897
ATGATCACAATTCCTTACATCACCGCCCTTACCACATACTTCAGCTACGGCCTCCTCTTCGCATTCGGTCAGCTCCGCGATTTTTTCCGAAAATTTTTCGACTGGTGGTCCAAGAGCAACCTTCAGGGTTACGCGCCAATCTGCTTGGGGCTTGAGGATTTCTATATTCGGAGATTGTATCTACGGATTCAGGATTGCTTTAATAGACCAATATCAAGCTCTCCTGATGCTTGGTTCGATGTGGTGGAGCGTATCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767581.1
MITIPYITALTTYFSYGLLFAFGQLRDFFRKFFDWWSKSNLQGYAPICLGLEDFYIRRLYLRIQDCFNRPISSSPDAWFDVVERISNDNNKTLKRTTKVKRCLNLGSYNYLGFAAADEYCTPRAIETLKKFSPSSCSTRVDGGTTTLHVELEKCVANYLGKEAAIVFGMGYATNSAILPVLMGKGRLIISDSLNHNSIVNGARGSGATIRVFQHNTPSHLEKVLREQIAEGQPRTHRPWKKIMVVVEGIYSMEGELCKLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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