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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000514`

染色体: Chr06 坐标: 4265715-4273364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000514`
名称	SmilChr06G000514
描述	eukaryotic translation initiation factor-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4265715 - 4273364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988063`
GeneID	`130988063`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988063`
原始查询	`SmilChr06G000514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor-like
产物	eukaryotic translation initiation factor-like
Arabidopsis	`AT5G57870` (eIFiso4G1) MIF4G domain-containing protein / MA3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835897] identity=64.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0499300` (Rymv1) - identity=60.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF02847 (MA3); PF02854 (MIF4G)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988063

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767805.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057767805.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057767805.1`
4	P-body	P-body	1.00000	`XP_057767805.1`
5	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4266142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B102,B20,C33,C58
`Chr6:4266178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C48,C61,C64,C66
`Chr6:4267709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,D10
`Chr6:4269293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:4269313`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,B119
`Chr6:4269313`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B111,B119
`Chr6:4269708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C61
`Chr6:4269739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:4270041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,D10
`Chr6:4270072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B130
`Chr6:4270892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:4271195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A9,B113,B132,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767805.1

785 aa

392

785

MIF4G

MA3

PF02854 MIF4G 212-436 aa PF02847 MA3 621-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767805.1`	Pfam	`PF02854`	MIF4G	Repeat	212	436	6.1e-52	177.0	MIF4G domain
`XP_057767805.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	621	732	2.5e-27	95.8	MA3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911822.1
CACACCCAAAAGAGGCAAAATTTATCTTTCCATATTCCTAAAAAAGCCCCCAGTGTTTTCCGCCACCGCCCTCCCAGACCCTCCTAAATTAGGGTTTTGCTCTCTCTTCCATGCCTTTGATAGCATTCCTCCCTTCTCACCTCCTCTCATTCTCACAGTAGAGAGAGGAAACAAGTTTCTTTCTCTCTCTAAAATTATATCCTTTTCCGGTCTTCAGTTTTTCCTATCTATCTTTGCGTCTATCTATACATACAAAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988063
ATGCAGGCTGATCAGACGGTGTTGAGCTTGAGACCAGGTGGCGGCACTCGCGGCGGAAGCAGAGTATTCGGCCCGCGCTTTGATTCCTCGTCGGCGAGCTCCGATCTTCCCCTGCTGCGTCCCCATGGCGGTATACCTGCGTCTTCGCTCACTTCCCTCAAGACTGGAGAGTCTCGATTTGATGGCCATGAACGGATCCGTTATACTAGAGACCAGCTTCTGCAGTTAAGAGAGGTGGTCAGCATCCCTGATGACATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767805.1
MQADQTVLSLRPGGGTRGGSRVFGPRFDSSSASSDLPLLRPHGGIPASSLTSLKTGESRFDGHERIRYTRDQLLQLREVVSIPDDILKVKQEVDAEFFGADPTWGRAEINLPTQTQNRYSEPDNRDWRNRSAQFQPPAEERSWEAIRDREFGGRFDSRQQDVNQYNKQEQLSSQFSRAQNSSNQGVAPALIKAEVPWSARRGSLSEKDRVLKTIKGILNKLTPEKFDILKGQLIESGITTADILKDVISLIFDKAVLEPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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