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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000546`

染色体: Chr06 坐标: 4562099-4564223 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000546`
名称	SmilChr06G000546
描述	uncharacterized SmilChr06G000546
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4562099 - 4564223 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988091`
GeneID	`130988091`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988091`
原始查询	`SmilChr06G000546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sdt97; symbol=Sdt97; hit=Os06g0649800; species=rice; confidence=high
产物	Sdt97; symbol=Sdt97; hit=Os06g0649800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G57970` (AT5G57970) DNA glycosylase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835908] identity=64.5; qcov=0.863; evalue=1.66e-90; confidence=high
Rice	`Os06g0649800` (Sdt97) - identity=62.8; qcov=0.858; evalue=1.9e-91; confidence=high
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008725 (DNA-3-methyladenine glycosylase activity)
KEGG	smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03352 (Adenine_glyco)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988091

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057767832.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057767833.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057767833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767832.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4562745`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr6:4562745`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr6:4563093`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C22,C65
`Chr6:4563093`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C22,C65
`Chr6:4563097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C65
`Chr6:4563255`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B37,B58,C55,C78
`Chr6:4563255`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B37,B58,C55,C78
`Chr6:4563489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4563523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:4563879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C65
`Chr6:4563911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:4563915`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B10,B31,B55,B58,B8,C2,C3,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767832.1

229 aa

114

229

Adenine_glyco

PF03352 Adenine_glyco 49-222 aa

XP_057767833.1

219 aa

110

219

Adenine_glyco

PF03352 Adenine_glyco 49-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767832.1`	Pfam	`PF03352`	Adenine_glyco	Family	49	222	2.6e-64	217.0	Methyladenine glycosylase
`XP_057767833.1`	Pfam	`PF03352`	Adenine_glyco	Family	49	212	3.1e-54	184.2	Methyladenine glycosylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911850.1
TCAAAATCCACTTCCTGTCTTGTTTACTTTTGGGTTATCTTAATTTTGTCACAGTGAAAAAGGTGAATTCGCAGCCCACCTCTCTAAGCAAAGCAAATGCCTCACTGCGTTTTGTTCTTCCTTGCTTTGCTCCATAAATTTATAATTCATCAGCAGGGTGAAATAAAGATTGAATTTTTAACCATCCAATGCTCAATTCTTGAATATCTGTGGTCGCATTTCTCTTTCTTCATTTAATTTTCCCACAATTTTTTCTTTGG...

XM_057911849.1
TGTCTTGTTTACTTTTGGGTTATCTTAATTTTGTCACAGTGAAAAAGGTGAATTCGCAGCCCACCTCTCTAAGCAAAGCAAATGCCTCACTGCGTTTTGTTCTTCCTTGCTTTGCTCCATAAATTTATAATTCATCAGCAGGGTGAAATAAAGATTGAATTTTTAACCATCCAATGCTCAATTCTTGAATATCTGTGGTCGCATTTCTCTTTCTTCATTTAATTTTCCCACAATTTTTTCTTTGGCCACACTGACACATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988091
ATGAATAGTGGTGAGAGGTTGATTGATGATAAGAAGGCATTTGGGAAGGTAGAGAAATCAAAAGGGGAAGTAGTAAACTCAAACCCAACAAATAATGCTCTTGCTATTCAACCCAAGAGAAGGTGTGCTTGGGCTGTTTCTCTTAACACCGATCCATCTTATGTCGCGTTTCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCGGCACACGATGACAAAAAATTGTTCGAACTTCTTGTCCTTTCCAGCGCGTTGGCTGAGCTTGCATG...

LOC130988091
ATGAATAGTGGTGAGAGGTTGATTGATGATAAGAAGGCATTTGGGAAGGTAGAGAAATCAAAAGGGGAAGTAGTAAACTCAAACCCAACAAATAATGCTCTTGCTATTCAACCCAAGAGAAGGTGTGCTTGGGCTGTTTCTCTTAACACCGATCCATCTTATGTCGCGTTTCATGATGAAGAATGGGGAGTCCCGGCACACGATGACAACGCGTTGGCTGAGCTTGCATGGCCTGCTATTCTGAGAAAAAGGCACATATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767832.1
MNSGERLIDDKKAFGKVEKSKGEVVNSNPTNNALAIQPKRRCAWAVSLNTDPSYVAFHDEEWGVPAHDDKKLFELLVLSSALAELAWPAILRKRHIFRQVFADFDPIAVAKLSDKTITTPGSLATSLLSELKLRSITQNARQVLKVIDEFGSLDKYMWSFVKHKPIVSSFRHGRQVPVKSPRAELISKDLVRRGFRGVGPTVVYAFMQVAGLTNDHLITCFRFHHLYHT

XP_057767833.1
MNSGERLIDDKKAFGKVEKSKGEVVNSNPTNNALAIQPKRRCAWAVSLNTDPSYVAFHDEEWGVPAHDDNALAELAWPAILRKRHIFRQVFADFDPIAVAKLSDKTITTPGSLATSLLSELKLRSITQNARQVLKVIDEFGSLDKYMWSFVKHKPIVSSFRHGRQVPVKSPRAELISKDLVRRGFRGVGPTVVYAFMQVAGLTNDHLITCFRFHHLYHT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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