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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000624`

染色体: Chr06 坐标: 5489161-5492702 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000624`
名称	SmilChr06G000624
描述	probable flavin-containing monooxygenase 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5489161 - 5492702 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988174`
GeneID	`130988174`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988174`
原始查询	`SmilChr06G000624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable flavin-containing monooxygenase 1
产物	probable flavin-containing monooxygenase 1
Arabidopsis	`AT1G19250` (FMO1) flavin-dependent monooxygenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838508] identity=41.4; qcov=0.994; evalue=2.61e-137; confidence=medium
Rice	`Os04g0223500` - identity=53.4; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004499 (N,N-dimethylaniline monooxygenase activity); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding); GO:0050661 (NADP binding)
KEGG	smil00430 (Taurine and hypotaurine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00743 (FMO-like); PF07992 (Pyr_redox_2); PF13434 (Lys_Orn_oxgnase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988174

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057767939.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057767939.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767939.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767939.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5489593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:5490080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B140,C82
`Chr6:5490365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:5490377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C43
`Chr6:5492303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767939.1

525 aa

262

525

FMO-like

Pyr_redox_2

NAD_binding_8

Lys_Orn_oxgnase

PF00743 FMO-like 3-501 aa PF07992 Pyr_redox_2 4-239 aa PF13450 NAD_binding_8 7-42 aa PF13434 Lys_Orn_oxgnase 132-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767939.1`	Pfam	`PF00743`	FMO-like	Family	3	501	2e-36	126.3	Flavin-binding monooxygenase-like
`XP_057767939.1`	Pfam	`PF07992`	Pyr_redox_2	Domain	4	239	9.6e-10	39.1	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
`XP_057767939.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	7	42	2.3e-09	38.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057767939.1`	Pfam	`PF13434`	Lys_Orn_oxgnase	Family	132	239	6.7e-08	32.7	L-lysine 6-monooxygenase/L-ornithine 5-monooxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911956.1
TGAAACAAAATCTTCTGGGTTGTCCAGCTTGACCAACGGGCATTTTATATTGTTTTCTAGTGACCATGCAGTCGCGCCTCACCTCCAGTTATTTTAATGGCTCAATTATTAATTTTCTCCTTCCTCAACTCGTGGCGTTGTCTACTTATTCAAAACCACACATCGCTTAAGTTTTTGCAAGATTCACAAGCTGGAGATTCAGCATCTCATCAATGGAGAAACGCGTAGCCATCGTGGGCGCCGGAATCAGCGGCCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988174
ATGGAGAAACGCGTAGCCATCGTGGGCGCCGGAATCAGCGGCCTCCTCGCCTGCAAATACGCGGCGGCCAGAGGCTTCACTCCGATGGTTTTCGAAGCGCAGGATCACGTGGGCGGGCTGTGGAACCACACCATTGAATCCACGAGGCTCCAGAATGCGAGGGTTACCTTCCAATTCTCTGATTTCCCATGGCCTCGCTCCGTTGAAGATATGTTCCCCACCAACTTCCAAGTCGTCGAATATCTGCAATCATATGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767939.1
MEKRVAIVGAGISGLLACKYAAARGFTPMVFEAQDHVGGLWNHTIESTRLQNARVTFQFSDFPWPRSVEDMFPTNFQVVEYLQSYAQNFGLLPYMRFNSKVMSIDYVGESEEEMRSWELWGAMGKPFGSKGKWILKVFHSNQNFTQEYEAEFVIICIGRFSGLPDIPKFAAGFGPEIFSGKVLHSMDFSDMDNAAAADFIKGKRVAIIGSGKTAVDTAFECANANGTDYPCTMIQRTPHWALPNAFPWGVHFGYFCATRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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