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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000639`

染色体: Chr06 坐标: 5651680-5654412 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000639`
名称	SmilChr06G000639
描述	uncharacterized SmilChr06G000639
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5651680 - 5654412 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990400`
GeneID	`130990400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990400`
原始查询	`SmilChr06G000639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0610000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40087` (AT1G40087) Plant transposase (Ptta/En/Spm family) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840721] identity=24.92; qcov=0.535; evalue=1.87e-21; confidence=weak
Rice	`Os04g0610000` - identity=30.04; qcov=0.436; evalue=1.37e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF03017 (Transposase_23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990400

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5651697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,D8,D9
`Chr6:5651718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C42,C56,C68
`Chr6:5651720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:5651740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C36
`Chr6:5651868`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	B10,B124,B20,B29,B6,B60,B65,B72,C10,C46,C59,C66,C7,C82,C83,D8,D9
`Chr6:5651914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr6:5652150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:5652319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B41,B69,C3,C69
`Chr6:5652375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B112,B41,C3,C69
`Chr6:5652398`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,B112,B122,B33,B57,C52,C69
`Chr6:5652402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:5652688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770621.1

550 aa

275

550

Transposase_24

Transposase_23

PF03004 Transposase_24 264-390 aa PF03017 Transposase_23 468-533 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770621.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	264	390	1.2e-21	78.0	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)
`XP_057770621.1`	Pfam	`PF03017`	Transposase_23	Domain	468	533	3.3e-12	46.8	TNP1/EN/SPM transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914638.1
ATGGCTCTGAGGACTCGGAGATCAAAACTGTGCAGAAAGTCGAATTATGAATTACAAGATGAGGAGATCGAGATTTATGAGCAACAAATCAAACAAGCAGCTATTGATCAGCAAGTTGCCAATAAAATAAAGGAGCATGGACAGCAGGATAGTGTTATGAAATCACAACCAAAAATTAGTCAAGTAGCTCGGGGACAACAGGCTATTGGGGGTCAAGATATGACTTTGAGGACTCGAAAATCAATTGCACAAAGAAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080392.1_cds_XP_057770621.1_31297
ATGGCTCTGAGGACTCGGAGATCAAAACTGTGCAGAAAGTCGAATTATGAATTACAAGATGAGGAGATCGAGATTTATGAGCAACAAATCAAACAAGCAGCTATTGATCAGCAAGTTGCCAATAAAATAAAGGAGCATGGACAGCAGGATAGTGTTATGAAATCACAACCAAAAATTAGTCAAGTAGCTCGGGGACAACAGGCTATTGGGGGTCAAGATATGACTTTGAGGACTCGAAAATCAATTGCACAAAGAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770621.1
MALRTRRSKLCRKSNYELQDEEIEIYEQQIKQAAIDQQVANKIKEHGQQDSVMKSQPKISQVARGQQAIGGQDMTLRTRKSIAQRKLNHRLQDEDVSHRLQDEEEIQEYEQQSTNQTEENEQQLQPEFSEGQGSSKKSRGPTYLPNLWARNSNEGRILVNFNKRGQPIGPNKKIFTGFLGTLARNSRFTPLDIEDWRKMPKIRKDELLRMVKERFEVPKDADHWILLSIGKKRRHWKSRVKGGSFVPTLAIENQAHNRPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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