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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000803`

染色体: Chr06 坐标: 7491617-7495662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000803`
名称	SmilChr06G000803
描述	ras-related protein Rab7
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7491617 - 7495662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988341`
GeneID	`130988341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988341`
原始查询	`SmilChr06G000803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein Rab7
产物	ras-related protein Rab7
Arabidopsis	`AT1G52280` (RABG3d) RAB GTPase homolog G3D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841658] identity=92.2; qcov=1; evalue=1.26e-143; confidence=high
Rice	`Os01g0227300` (OsRab7B1) - identity=88.9; qcov=1; evalue=1.55e-139; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005774 (vacuolar membrane)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF04670 (Gtr1_RagA); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057768140.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057768140.1`
3	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057768140.1`
4	Endosome	内体	1.00000	`XP_057768140.1`
5	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057768140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7491833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr6:7495233`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B120,B127,B92
`Chr6:7495233`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B120,B127,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768140.1

206 aa

103

206

Arf

MMR_HSR1

Roc

Gtr1_RagA

Ras

GTP_EFTU

PF00025 Arf 9-174 aa PF01926 MMR_HSR1 10-104 aa PF08477 Roc 10-128 aa PF04670 Gtr1_RagA 10-129 aa PF00071 Ras 10-176 aa PF00009 GTP_EFTU 47-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	9	174	3.8e-12	46.7	ADP-ribosylation factor family
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	10	104	4.7e-07	30.6	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	10	128	1.3e-32	113.2	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF04670`	Gtr1_RagA	Domain	10	129	3.1e-05	24.2	Gtr1/RagA G protein conserved region
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	10	176	1.8e-54	184.4	Ras family
`XP_057768140.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	47	174	1.5e-07	31.9	Elongation factor Tu GTP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912157.1
AGCTTTAATTATACGATTAATCAGAAGCACAAATTTAACTAGAAAGAGGGGGAAAATAAACTAAAGAATCTTGGTGTTTGTATATTCTATTTCTGGGCACAAATATATTTTCAGAATTGTGTATTTTTGGTCTCCTGTAAAAGCGAGCCGAGCTCCACAAATTCTCTCATTCGCGTCTCAATTTGACGTTGCAGAATCGAAATCTGAATGGCGTCTCGTCGCCGTGTCCTTCTCAAGGTCATCATTCTCGGCGACAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988341
ATGGCGTCTCGTCGCCGTGTCCTTCTCAAGGTCATCATTCTCGGCGACAGCGGGGTTGGTAAGACGTCTTTGATGAATCAATATGTGAATAGGAAATTCAGTAATCAGTATAAAGCTACAATTGGGGCTGATTTCCTGACCAAAGAGGTCCAGTTTGAGGATAGGATTTTCACCTTGCAGATATGGGATACTGCTGGTCAAGAGAGGTTTCAAAGCCTTGGTGTGGCTTTCTACCGAGGTGCAGATTGTTGTGTGCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768140.1
MASRRRVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNRKFSNQYKATIGADFLTKEVQFEDRIFTLQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVYDVNVMKSFDNLSNWREEFLIQASPPDPENFPFVVLGNKIDVDGGNSRVVSEKKAKTWCASKGSIPYFETSAKEGFNVDAAFECIAKNALKNEPEEELYLPDTIDMASGQQQRSSGCEC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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