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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000876`

染色体: Chr06 坐标: 8282675-8288911 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000876`
名称	SmilChr06G000876
描述	4-coumarate--CoA ligase-like 9
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8282675 - 8288911 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988410`
GeneID	`130988410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988410`
原始查询	`SmilChr06G000876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-coumarate--CoA ligase-like 9
产物	4-coumarate--CoA ligase-like 9
Arabidopsis	`AT5G63380` (AT5G63380) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836457] identity=56; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0901600` (OsACS6) - identity=51.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016405 (CoA-ligase activity)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057768215.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768215.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768215.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057768215.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8283097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:8283108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:8283224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:8283361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr6:8283691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:8287035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:8287073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C86
`Chr6:8287120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:8287413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:8288407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:8288481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C64,C7
`Chr6:8288611`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A2,A25,A8,B112,B128,B130,B133,B134,B25,B33,B35,B49,B5,B50,B52,B55,B67,B8,B84,B89,C17,C3,C33,C44,C53,C66,C73,C76,C77,C83,D1,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768215.1

547 aa

274

547

AMP-binding

AMP-binding_C

PF00501 AMP-binding 50-402 aa PF13193 AMP-binding_C 454-529 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768215.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	50	402	3.8e-77	260.4	AMP-binding enzyme
`XP_057768215.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	454	529	2.1e-16	61.3	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912232.1
TCTTGATAATAAATACTGAGCCCCAACACCCCACCCCCACCCCGTTGTCATCAGCTGAAAGCTCATTCCCATGGCTGAAACCAGCTCCTTCAATCCCCAAAATGGCTTCTGCCCACAAACCAAAATATACCACAGCCTCCGCCCCGCCGTCCCTCTCCCGCCGCCGTCTCAGCACCTCTCCATCTTCCAATACGCTCTCTCCCTCCTCCACTCAACCGCCAACCCCAGCACCCCCTTCCTCATCGATGCCGCCACCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988410
ATGGCTGAAACCAGCTCCTTCAATCCCCAAAATGGCTTCTGCCCACAAACCAAAATATACCACAGCCTCCGCCCCGCCGTCCCTCTCCCGCCGCCGTCTCAGCACCTCTCCATCTTCCAATACGCTCTCTCCCTCCTCCACTCAACCGCCAACCCCAGCACCCCCTTCCTCATCGATGCCGCCACCTCCCGCCACCTCACCTACTCCGCCTTCCTCCGCCAAGTGGCCTCCCTCTCTATCTCCCTGAAACCCCTCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768215.1
MAETSSFNPQNGFCPQTKIYHSLRPAVPLPPPSQHLSIFQYALSLLHSTANPSTPFLIDAATSRHLTYSAFLRQVASLSISLKPLLSNNDVAFILSPASLHIPVLYFSLLSLGVAVSPSNPLSSPADLAHQIRISRPAVVFATSETSKKLPQINIPIIILDSPRFLSMLECDASLSSAARDQSSTAAILYSSGTTGRMKGVQLTHRNLIALVAVVYHNKLAEDEKLAEKNGGAAVSILTVPLFHVFGFFKVIKAAAFGES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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