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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000910`

染色体: Chr06 坐标: 8580484-8582255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000910`
名称	SmilChr06G000910
描述	probable polyamine oxidase 5
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8580484 - 8582255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988445`
GeneID	`130988445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988445`
原始查询	`SmilChr06G000910`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polyamine oxidase 5
产物	probable polyamine oxidase 5
Arabidopsis	`AT4G29720` (PAO5) polyamine oxidase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829093] identity=55.1; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0710200` (PAO1) - identity=45.4; qcov=1.06; evalue=5.22e-143; confidence=high
GO	GO:0046592 (polyamine oxidase activity)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768265.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768265.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057768265.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768265.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8580561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr6:8580655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:8580738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:8580939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B90,B92,C21
`Chr6:8580996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A7,B112,B42,B43
`Chr6:8581186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B94
`Chr6:8581257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B13
`Chr6:8581294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C20
`Chr6:8581340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr6:8581405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:8581411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B64,B90,C21,D3
`Chr6:8581432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A15,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768265.1

508 aa

254

508

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF13450 NAD_binding_8 10-75 aa PF01593 Amino_oxidase 15-499 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768265.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	10	75	7.4e-12	46.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057768265.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	15	499	5.7e-70	237.5	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912282.1
AAGAAAAGATCCCTTACTAAGCGATTACTACTACACCTTATATATCCTCTCCAACTATCTCATCCTCAACCTCACAAACATCACACAAAAAAAAAATAAAAAATCAAAAAATAAAAAGAAAATTCCTTCACTGTCAAGAATCATCATCTTCCTTTTTTGTCCGAGCGTTGTTCTTCCCTTCGCCTTTAGTGATAGTGATAAGTTGAAAAATGGTGAGCAAAAAGCCCAGGGTGGTAATAATCGGCGCCGGAATGGCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988445
ATGGTGAGCAAAAAGCCCAGGGTGGTAATAATCGGCGCCGGAATGGCCGGCCTCACCGCCGCCAACAAGCTGCACACAGCCGCCGCCAACAAGATGGAGCTGGCGGTGGTGGAGGGCGGCACCAGGATCGGCGGCCGGATCAGCACCTCCGAATTCTCCGGCGACCGGATTGAGCAGGGCGCCACGTGGATCCACGGGATTGAAGGCAGCCCCGTTTACAAAATCGCCGCCCAAACGAACTTGCTCGTCTCCGACCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768265.1
MVSKKPRVVIIGAGMAGLTAANKLHTAAANKMELAVVEGGTRIGGRISTSEFSGDRIEQGATWIHGIEGSPVYKIAAQTNLLVSDQPWECMDGTLEDPVTAAEGGHVLAPAFVDPISRLFKNLMDFIQCKLDAQAAGHCAGELSVGSFLRRGLAAYLELEKEKKAAAAVGSWSKRSLQQAVFAMHESTQRTYTSADDLCTLDYNAEKDYVLFPGEEITIAGGYSGVIDHLASVLPTGVIQLGRKVERIEWAPAGGDDGGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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