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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001015`

染色体: Chr06 坐标: 10047927-10051822 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001015`
名称	SmilChr06G001015
描述	probable pectinesterase 53
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10047927 - 10051822 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988549`
GeneID	`130988549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988549`
原始查询	`SmilChr06G001015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase 53
产物	probable pectinesterase 53
Arabidopsis	`AT5G19730` (AT5G19730) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832093] identity=76.5; qcov=0.928; evalue=1.28e-153; confidence=high
Rice	`Os05g0521600` (OsPME18) - identity=73.5; qcov=0.932; evalue=7.84e-147; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057768414.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057768414.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057768415.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768414.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10048307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:10048826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B54,C81
`Chr6:10048946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C27,C82
`Chr6:10049099`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B136,B36,C42
`Chr6:10049099`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B136,B36,C42
`Chr6:10049138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:10049308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768414.1

352 aa

176

352

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 66-346 aa

XP_057768415.1

279 aa

140

279

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 25-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768414.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	66	346	6.6e-73	245.8	Pectinesterase
`XP_057768415.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	25	273	1.9e-63	214.7	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912431.1
TGAGAAACAAACAAATGAGTCATGCACTCCCTCACGGGCCTCATCTCTTTAATTCTAAAAGCGCATTCGTGGGAACCTGCTTTTTGGCCTGTGATAATTTCTAACACATCACATATATTCTACCCGTGACACCTCTCTCATGCTTCTCCAATCATCCCCACCTCACCAAATCCAAAAACTAACACTTGACACCATTATTATTTCCTATATATAGTCCTTTCTCCGAAACTCATGATCCACCACTCTTCAATTAACAAATG...

XM_057912432.1
ATGCAATGCCAATGCCAATGCCTTGTCGTCTGATTTTCCATGCGACAATTGTGCTTCTGTTGCTGAATACAAGATGCCACACCACGGAGCAGCAGTTCATGAAATGGGTTGATTTTGTGGGAAGCCTCAACCATTCCCTATTCAAGACCGCCACCAACAAGGCCTCACCATATCGCACCATCACAGTCCACAAAAATCCCAAATATGGAGACTTCACATCCATTCAGGATGCAATTCACTCTATACCTACCATCAATCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988549
ATGCCAATGCCAATGCCTTGTCGTCTGATTTTCCATGCGACAATTGTGCTTCTGTTGCTGAATACAAGATGCCACACCACGGAGCAGCAGTTCATGAAATGGGTTGATTTTGTGGGAAGCCTCAACCATTCCCTATTCAAGACCGCCACCAACAAGGCCTCACCATATCGCACCATCACAGTCCACAAAAATCCCAAATATGGAGACTTCACATCCATTCAGGATGCAATTCACTCTATACCTACCATCAATCTTCTCAG...

LOC130988549
ATGGAGACTTCACATCCATTCAGGATGCAATTCACTCTATACCTACCATCAATCTTCTCAGAGTCCTCATCAAGTGAGAAGGTGACAATACCTCCATTGAAATCATACATAACGATCGAAGGCGGCGGAGCAGACGAAACCATAGTGCAATGGGGCGACACAGCCGCAACGCAGCCTCTGGGTACGTACGGGTCGGCCACATTCGCGGTGAACTCCCCATTCTTCATCGCGAAGAACATCACATTCAAGAACACGACGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768414.1
MPMPMPCRLIFHATIVLLLLNTRCHTTEQQFMKWVDFVGSLNHSLFKTATNKASPYRTITVHKNPKYGDFTSIQDAIHSIPTINLLRVLIKVHAGIYTEKVTIPPLKSYITIEGGGADETIVQWGDTAATQPLGTYGSATFAVNSPFFIAKNITFKNTTPVPAAGAVGKQAVAFRISGDTAVLVGCKFVGAQDTLYDQVGRHYYKDCYMEGSVDFIFGNGLSLFENCDVHAIAPRVGAVTAQGRSSILESSGFSFVKCRV...

XP_057768415.1
METSHPFRMQFTLYLPSIFSESSSSEKVTIPPLKSYITIEGGGADETIVQWGDTAATQPLGTYGSATFAVNSPFFIAKNITFKNTTPVPAAGAVGKQAVAFRISGDTAVLVGCKFVGAQDTLYDQVGRHYYKDCYMEGSVDFIFGNGLSLFENCDVHAIAPRVGAVTAQGRSSILESSGFSFVKCRVRGSGALYLGRAWGPFSRVVFSYTYMDNIIIPKGWYNWGDPSRQMTVFYGQYKCTGAGAKFAGRVAWSRELTDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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