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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001188`

染色体: Chr06 坐标: 12106823-12112030 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001188`
名称	SmilChr06G001188
描述	probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12106823 - 12112030 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988707`
GeneID	`130988707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988707`
原始查询	`SmilChr06G001188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial
产物	probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G02090` (MPPBETA) Insulinase (Peptidase family M16) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821084] identity=75.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0212700` - identity=74.8; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006508 (proteolysis); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00675 (Peptidase_M16); PF05193 (Peptidase_M16_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768613.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057768613.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057768613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12107098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12107435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:12107642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C43
`Chr6:12108827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B87,D9
`Chr6:12109072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:12109624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:12109822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:12111550`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B5
`Chr6:12111550`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768613.1

526 aa

263

526

Peptidase_M16

Peptidase_M16_C

PF00675 Peptidase_M16 102-249 aa PF05193 Peptidase_M16_C 256-441 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768613.1`	Pfam	`PF00675`	Peptidase_M16	Family	102	249	2.1e-56	190.7	Insulinase (Peptidase family M16)
`XP_057768613.1`	Pfam	`PF05193`	Peptidase_M16_C	Domain	256	441	3.6e-41	141.8	Peptidase M16 inactive domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912630.1
GTGTATTGGACTAGTTTTAAGCCCTGGGCCGATTGTGAAGGGAAAAGAATGAGCCAGATGCAACGACGTCGTTATCGGATCTCAAGTATATGAAATGAAATGAGACTTTGCTAATTTCTGGTTGCTCGACTCCCTACCTCGTCTCCACGACGAAACCCTAATCATCACTTAACACAAACATTTCACCACCGCTACCGCCACCGCCACCGCCGGAGCCGCGGCCATGACGATCCGCCAGCTAATAAACATCGGTCTCCGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988707
ATGACGATCCGCCAGCTAATAAACATCGGTCTCCGTAACCGGAGACCAATCCGCCCATTCACTGCTGCCCGACCTCACTCCACCGCTGTCGCCACCTCCGCCGACGCAACCCTCCCGTCTCCTCCGCCACCAACCGCCATGATCTACGATCGATTGGCGGAAAGTGTGAAGGAGAAGCTGAAAAGGCTGGAGGACCCCGATCCTCGCTTCCTCCGGTACAACTCCCCGCATCCAACATTAGATTCTCACGCCGAAATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768613.1
MTIRQLINIGLRNRRPIRPFTAARPHSTAVATSADATLPSPPPPTAMIYDRLAESVKEKLKRLEDPDPRFLRYNSPHPTLDSHAEILSAPLTRVTTLPNGLRIATESNLATTTATVGVFIDAGSRFESDETNGTAHFLEHMIFKGTEKRTARQLEEEIENMGGHLNAYTSREQTTYYAKVFDKDVPRALDILSDILQNSKFEETRITRERDVILREMEEVEGQTEEVIFDHLHATAFQYTPLGRTILGPAENVRKIGKKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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