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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001267`

染色体: Chr06 坐标: 13243847-13246068 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001267`
名称	SmilChr06G001267
描述	probable pectate lyase P59
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13243847 - 13246068 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988774`
GeneID	`130988774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988774`
原始查询	`SmilChr06G001267`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase P59
产物	probable pectate lyase P59
Arabidopsis	`AT1G14420` (AT59) Pectate lyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838004] identity=56.2; qcov=1.01; evalue=1.8e-179; confidence=high
Rice	`Os06g0144200` - identity=56.2; qcov=0.935; evalue=2.63e-162; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4); PF04431 (Pec_lyase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057768714.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768714.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768714.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768714.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13244087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C21
`Chr6:13244183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A1,B103,B108,B129,B22,B36,B58,B73,B81,C36,C79
`Chr6:13244813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr6:13244856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:13244913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B134,B60,B78,D8
`Chr6:13245069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C27,C31,C56,C65,C70
`Chr6:13245210`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A19,A24,B109,B117,B127,B139,B24,B31,B37,B38,B67,B8,B89,B90,C28
`Chr6:13245213`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A19,A24,B117,B127,B139,B24,B31,B37,B38,B67,B8,B89,B90,C28
`Chr6:13245266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768714.1

449 aa

224

449

Pec_lyase_N

Pectate_lyase_4

PF04431 Pec_lyase_N 29-88 aa PF00544 Pectate_lyase_4 187-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768714.1`	Pfam	`PF04431`	Pec_lyase_N	Family	29	88	1.2e-14	55.0	Pectate lyase, N terminus
`XP_057768714.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	187	379	6.3e-21	75.5	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912731.1
TTAGAAACTCTGGCAATATCTAAAATCCATTATACATGCAAACACAAAAAAGGAAATAGGTTATTCGTAGTTTTCAATACAACTTCTGTTTCTTACCTCCAAAATATGAGCCTAGCTCGAAATATATATGTTCTAGCTTAACGGAGAGTCGGAACCCGAAAAGCTACAGTGTAGTTCGAGCGAGCTAGGCCGAATTTAAGCCATTTGAATAGTAAGAGCTGAGCAGCTAGGAAAGAAAATGAAAGAAATTAAGATGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988774
ATGAAAGAAATTAAGATGAATTCATGGTTGTTAATGGTGTGTTTTGGTTTTGGTTTTGGTTGGATGTCACAAGTCGTTAATGGTAATATTGGAGAATGGGATGAGGTGTGGAAGAAGCGCTCCGAGGAGTCTTGGAATAGAACTCTTGAGACCTATGAGCCCATCCCAGAACACATAGTTAGTCATTTGAATGTGCATGCCAAAAAGGCAGTAAAGGAAATAGAAAAAGTAAGTTCAGATGCAAATAGCACAAGAAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768714.1
MKEIKMNSWLLMVCFGFGFGWMSQVVNGNIGEWDEVWKKRSEESWNRTLETYEPIPEHIVSHLNVHAKKAVKEIEKVSSDANSTRRELLRGYTGPCMVTNPIDRCWRCQPNWAQRRFRLADCVLGFGYKTTGGKNGAFYVVTDPSDSDLISPRPGTLRHAVIQKEALWIIFERSMLIVLQQELIMQGDKTIDGRGVRVDIAYGAGITIQFVSNVIIHNIRIHDIVSKSGGMIRDSVDHYGFRTVSDGDGISIFGSQNIWI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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