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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002064`

染色体: Chr06 坐标: 27161106-27170007 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002064`
名称	SmilChr06G002064
描述	histone-lysine N-methyltransferase CLF
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27161106 - 27170007 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988962`
GeneID	`130988962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988962`
原始查询	`SmilChr06G002064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase CLF
产物	histone-lysine N-methyltransferase CLF
Arabidopsis	`AT2G23380` (CLF) SET domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816870] identity=59.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0275500` (CLF) - identity=55.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0031519 (PcG protein complex); GO:0042054 (histone methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET); PF18264 (preSET_CXC); PF25996 (HTH_CLF_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768934.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057768934.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057768934.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768934.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27161547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:27161565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C43,D7
`Chr6:27161616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D10
`Chr6:27162106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D1
`Chr6:27163860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B52
`Chr6:27164190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:27165029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:27165056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:27166191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:27166275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D4
`Chr6:27168501`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C5
`Chr6:27168501`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768934.1

882 aa

441

882

HTH_CLF_N

preSET_CXC

SET

PF25996 HTH_CLF_N 204-246 aa PF18264 preSET_CXC 671-702 aa PF00856 SET 744-847 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768934.1`	Pfam	`PF25996`	HTH_CLF_N	Domain	204	246	9.9e-16	57.8	Histone-lysine N-methyltransferase CLF, N-terminal HTH domain
`XP_057768934.1`	Pfam	`PF18264`	preSET_CXC	Domain	671	702	7.8e-08	33.4	CXC domain
`XP_057768934.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	744	847	1.9e-19	70.7	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912951.1
AGGGGCGGGGGGTGGGTGGGATATGGGTAGCGACCAACGCTGAAAAGCGCCCCCTCTGTCAGGCCCACCACATCCGCCACCTCCTCAATATCCATTTTTAGGGTTTTCAAATTCCAAGCGCCAAATCGCCAATCCCACCTCCTTTCCCCCCTTTTTGCATGACTCGGATCTGCAATCCGACCTCCATTGCCGGATCGAGCGCCCCGCCGCCTTATCTGATCCTCCTCCGGCAATGTCGGCGCCCAAGGCCTCCCCCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988962
ATGTCGGCGCCCAAGGCCTCCCCCTCCGCCTCCGGATCCGACCCTCATGTAGCTGACCACCAAGAAAATAGTTCGTCAGCACAGGAGATTGTAGCTGTTATTGAATCTTTAAAGACACAAGTTTCTTTGAACCGCTGTGCCTATATAAAGAAACGGATTGAAGAAAATGCTGAGAAAGTGCTTGATGTTACAAAAAATCTCTATAAGTTATCTATGGAAAGAAGAAATTTTAAGATTATTTGTGGTGATGGAGGTGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768934.1
MSAPKASPSASGSDPHVADHQENSSSAQEIVAVIESLKTQVSLNRCAYIKKRIEENAEKVLDVTKNLYKLSMERRNFKIICGDGGVDLLAKRQKDAIDMHNGIGTSNGDNESSSSQEDGYAPSAILLGSSIAVKNAVRPIKLPEVKKLPPYTTWIFLDRNQRMTEDQSVVGRRRIYYDQNGGEALICSDSEEEAVDDEEEKKEFVESEDYILRMTIKQMGFSDMTLDVLGQCLSRRSGELKARFEDHIKNNSTTSRVSNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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