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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002362`

染色体: Chr06 坐标: 34401580-34407847 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002362`
名称	SmilChr06G002362
描述	alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34401580 - 34407847 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989179`
GeneID	`130989179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989179`
原始查询	`SmilChr06G002362`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
产物	alpha-1%2C3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase
Arabidopsis	`AT4G38240` (CGL1) alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829981] identity=77.1; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0832800` (GlcNAc-TI) - identity=71.6; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003827 (alpha-1,3-mannosylglycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006486 (GO:0006486)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03071 (GNT-I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769102.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057769102.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769102.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34402870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A2,B1,B105,B114,B118,B123,B139,B17,B24,B33,B47,B78,B8,C36,C61,C75
`Chr6:34402872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C49,C59
`Chr6:34405205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:34405972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C62
`Chr6:34406653`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B7,B94
`Chr6:34406653`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B7,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769102.1

442 aa

221

442

GNT-I

PF03071 GNT-I 15-441 aa

XP_057769103.1

408 aa

204

408

GNT-I

PF03071 GNT-I 7-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769102.1`	Pfam	`PF03071`	GNT-I	Family	15	441	7e-188	625.6	GNT-I family
`XP_057769103.1`	Pfam	`PF03071`	GNT-I	Family	7	407	2.8e-179	597.2	GNT-I family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913119.1
ACGTAAAATTTTCAATTGGTTTAAACGAATATTGATTTAACGGCCGTAAAAAAGTTTGAGAGTGCGATATATTTCCTCTTGTGATCTACAAATGCATGGATTTGGAAATTCTGGTATTCAAACTTGAACAAGAGGGAAAAATCTATGTAACATTGCGTGGTTTGATGTAAAATATTGAAGCTAATTCAAGCTAGGGCGGATGGAAACACGTTCCGCGAAATAGTAGATGTTAATTTTCAGTTGGAATTTTAACTAACAAG...

XM_057913120.1
TAATAGAGGCTTATAAATATGTCTAACTCGTAAGGCACTCATGCCAACATTACCATATATCGAGGCAGAAAATCAGTGCACAAGACAGACACGATTACTGATAGATCAGATTAGCTCGCAACAAGGACGACTTCTTTCTCTTGAAGAAGAAAAGAAACGCCGAGATCTGGAGTGCAGCCAGTTGAGAGCTCTTGTTCAAGATCTGCAACGGAAGGGTGTTGAGAAACTGGTTGGTGATGTACAGGCTCCAGTAGCAGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989179
ATGAGGAGGTGCTCTTGCGACTACCGGTACCTCCTCCTCCTCGCCGCCGTGCCCTTCATCTACATCCAGATGCGCCTCTTTACAACTCAATCAGAGTATGCCGATCGCCTAAGTGATGCTATCGAGGCAGAAAATCAGTGCACAAGACAGACACGATTACTGATAGATCAGATTAGCTCGCAACAAGGACGACTTCTTTCTCTTGAAGAAGAAAAGAAACGCCGAGATCTGGAGTGCAGCCAGTTGAGAGCTCTTGTTCA...

LOC130989179
ATGCCAACATTACCATATATCGAGGCAGAAAATCAGTGCACAAGACAGACACGATTACTGATAGATCAGATTAGCTCGCAACAAGGACGACTTCTTTCTCTTGAAGAAGAAAAGAAACGCCGAGATCTGGAGTGCAGCCAGTTGAGAGCTCTTGTTCAAGATCTGCAACGGAAGGGTGTTGAGAAACTGGTTGGTGATGTACAGGCTCCAGTAGCAGCTGTCGTGGTTATGGCCTGTAACCGTGCTGATTACCTTGACAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769102.1
MRRCSCDYRYLLLLAAVPFIYIQMRLFTTQSEYADRLSDAIEAENQCTRQTRLLIDQISSQQGRLLSLEEEKKRRDLECSQLRALVQDLQRKGVEKLVGDVQAPVAAVVVMACNRADYLDRTIKSILTYQSPVASKYPLFISQDGSDPRVKSKALSYDHLTYMQHLDYEPVQTERPGELIAYYKIAQHYKWALDQLFYKHKFSRVIILEDDMEIAPDFFDFFEAGAALMDRDKSIMAVSSWNDNGQKQFVHDPYVLYRSD...

XP_057769103.1
MPTLPYIEAENQCTRQTRLLIDQISSQQGRLLSLEEEKKRRDLECSQLRALVQDLQRKGVEKLVGDVQAPVAAVVVMACNRADYLDRTIKSILTYQSPVASKYPLFISQDGSDPRVKSKALSYDHLTYMQHLDYEPVQTERPGELIAYYKIAQHYKWALDQLFYKHKFSRVIILEDDMEIAPDFFDFFEAGAALMDRDKSIMAVSSWNDNGQKQFVHDPYVLYRSDFFPGLGWMLSRSTWDELSPKWPKAYWDDWLRLKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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