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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002365`

染色体: Chr06 坐标: 34466262-34470766 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002365`
名称	SmilChr06G002365
描述	probable galacturonosyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34466262 - 34470766 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989182`
GeneID	`130989182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989182`
原始查询	`SmilChr06G002365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase 3
产物	probable galacturonosyltransferase 3
Arabidopsis	`AT4G38270` (GAUT3) galacturonosyltransferase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829984] identity=64.7; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0531900` - identity=66; qcov=0.725; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0047262 (polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF25557 (GAUT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769105.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057769105.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769105.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769105.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769105.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34466458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C20,C34
`Chr6:34467205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34467845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:34468927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34468981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:34469181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:34469458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34469503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C38
`Chr6:34469559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:34470404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769105.1

698 aa

349

698

GAUT_1

Glyco_transf_8

PF25557 GAUT_1 236-312 aa PF01501 Glyco_transf_8 356-671 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769105.1`	Pfam	`PF25557`	GAUT_1	Domain	236	312	1e-26	93.7	Galacturonosyltransferase domain 1
`XP_057769105.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	356	671	8.5e-80	268.7	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913122.1
ATACAAAGTCCAATGGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAACAACGAAAAAAATTCTAAATCAGTCGGCCAACGCTCACACCACTGTTCGTTTCTTCCCAGTTACCACTTATGAATTGTAAAATTAAGAAAGAAGGAAGAAGATTTCAATCAGCTGATCGAATTTCAAGTGGTTACTGCTCTCGTAAGATGAGAGGCGGTTTAACATCACAATCCCTTTCCGCGATCTTCCTTTTCCTCGGTATCAACATTTTCTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989182
ATGAATTGTAAAATTAAGAAAGAAGGAAGAAGATTTCAATCAGCTGATCGAATTTCAAGTGGTTACTGCTCTCGTAAGATGAGAGGCGGTTTAACATCACAATCCCTTTCCGCGATCTTCCTTTTCCTCGGTATCAACATTTTCTTGTCAGTCAGAGCAGAGGATACACGTGCATCTACGCTACGAAGAGAACATAAGCTGTATGCCCCATTATATGACTGTCCAAACTGTATTGAAAGAAAGGATCAAGGAAATACTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769105.1
MNCKIKKEGRRFQSADRISSGYCSRKMRGGLTSQSLSAIFLFLGINIFLSVRAEDTRASTLRREHKLYAPLYDCPNCIERKDQGNTSSTDHPWKEFDIIITYSDPSGAVQVRSVRSRDLSSSWVWRNPRKKKHDRVVQDPFQAKLIYRNNGDNWSDNRQFEGETLQTQTYPVHPVKLKRQMLRRERRERRTADLIKQDKEIENQMQEVAIKRARELDTNIKGKYSIWRKEYENPNSDSTVKLIRDQIIMAKAYATIAKAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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