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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002477`

染色体: Chr06 坐标: 35600335-35604205 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002477`
名称	SmilChr06G002477
描述	uncharacterized SmilChr06G002477
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35600335 - 35604205 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989276`
GeneID	`130989276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989276`
原始查询	`SmilChr06G002477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0560500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0560500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G14210` (PDS3) phytoene desaturase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827061] identity=21.2; qcov=0.872; evalue=2.89e-15; confidence=weak
Rice	`Os04g0560500` - identity=51; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057769215.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057769215.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057769215.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057769215.1`
5	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057769215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35600542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35600586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C37
`Chr6:35600591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A20,B103,B51
`Chr6:35600598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C37
`Chr6:35600610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35600673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35600676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B62,D10
`Chr6:35601004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:35601431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B34,C23,C85
`Chr6:35601438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35601599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:35601793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769215.1

531 aa

266

531

DAO

FAD_binding_2

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF01266 DAO 41-78 aa PF00890 FAD_binding_2 42-76 aa PF13450 NAD_binding_8 44-104 aa PF01593 Amino_oxidase 50-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769215.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	41	78	2.6e-12	47.7	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057769215.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	42	76	2.5e-07	31.0	FAD binding domain
`XP_057769215.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	44	104	1.1e-09	39.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057769215.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	50	484	9.1e-27	95.1	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913232.1
ACAAATAAGAAAGAATTAAGACACGAAACCTTAATAAATCAGAAGCCAAGTGGTGCACGCTTAACTTGGCTAATTTTTCGGGCCGAAAAATCCTCATCGAAAAGCCCGGGAGGAGGAATCAAACAGTCAGTTAGAGCCGTTATTAATATGCTGGCTTGTTGGAGGGCCCGGCCCGTTTTCCCACACGGCCCTACCGATTTGCGACGCGGGCTCTGCTGCAGAGCTGAGGAACAAGCGGTAGCTCTCACTCAACGCCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989276
ATGCTGGCTTGTTGGAGGGCCCGGCCCGTTTTCCCACACGGCCCTACCGATTTGCGACGCGGGCTCTGCTGCAGAGCTGAGGAACAAGCGGTAGCTCTCACTCAACGCCCGACCAAGAAGAAAATTGTTGTCGTGGGCTCGGGCTGGGCCGGGCTCGCTGCAGCTCACCACCTCTGTAAACAGGGATTTGATGTCACAGTTCTTGAAGGTGGATATGAACTTGGATGGAAAACTAAGTCTATTACTCCTGATGATGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769215.1
MLACWRARPVFPHGPTDLRRGLCCRAEEQAVALTQRPTKKKIVVVGSGWAGLAAAHHLCKQGFDVTVLEGGYELGWKTKSITPDDAGIRGFWYPFRNIFNLVDELGLKPFTNWTKSGQYSDEGLEVEYPIYQNSQQLPTPFGTLLNTKFARLPLVDRFTSLPLMAAVIDFDNTDSAWRKYDPITAREILRQFGCSERLYRDVFDPLIRVGLFAPPEQCSAAATLGMLYYFVLANQKHFDLKWCRGTVREGIFLPWMESLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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