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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002870`

染色体: Chr06 坐标: 41537458-41540651 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002870`
名称	SmilChr06G002870
描述	chorismate mutase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41537458 - 41540651 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989614`
GeneID	`130989614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989614`
原始查询	`SmilChr06G002870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chorismate mutase 1, chloroplastic-like
产物	chorismate mutase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G29200` (CM1) chorismate mutase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822573] identity=71.5; qcov=0.845; evalue=5.99e-142; confidence=high
Rice	`Os01g0764400` (CM) - identity=63.1; qcov=0.987; evalue=2.6e-126; confidence=high
GO	GO:0004106 (chorismate mutase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009073 (aromatic amino acid biosynthetic process); GO:0046417 (chorismate metabolic process)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01817 (CM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769610.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057769610.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769610.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769610.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41537693`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C40
`Chr6:41537693`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C40
`Chr6:41537811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B78,C2,C32,C68
`Chr6:41538402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:41538982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B84
`Chr6:41539237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:41540166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B47,B84,C34,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769610.1

316 aa

158

316

CM_2

PF01817 CM_2 198-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769610.1`	Pfam	`PF01817`	CM_2	Domain	198	307	5.1e-09	36.9	Chorismate mutase type II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913627.1
CACACCTAATTAATTCATTTACAATTATGTCGCCAAAACCACTAGTTCAATTTAAATTCCCACCCCAAATATGTTTCAACATTTATAGCTTGAAATTAGACCCATTATAATGGCTCATACAGTTTCAAAGAAGAATGTCGTGGATGAACTATCACTTGAGGAATATTTTTGAAATAAAATAATAAGTAATAAATATTTCTATACTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGATCCACTTCCTTCTACGCTTCTACCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989614
ATGGAGGCGAAGCTGTTGAGAGCTGCCTCTCCCACCGTGTCCGGCCCCTGCATTTCCAAGCCCTCGCGCCGTTTCGCCCACAAAAAATGGCAAACAAATCGCGCCGTCCGCTTTCAGAATTCGAGTATTGTCCCTCTCACAATTCGAGCTTCCGCAGCTACTCTTGGGTTGGAACCAAAGCATAGGATAGATGAGAGCGAGTGCTATACCCTTGATGGTATCAGAAACTCATTGATACGGCAAGAGGATAGCATTATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769610.1
MEAKLLRAASPTVSGPCISKPSRRFAHKKWQTNRAVRFQNSSIVPLTIRASAATLGLEPKHRIDESECYTLDGIRNSLIRQEDSIIFGLVERAQFCYNGETYDPNAFAMKGFSGSLIEYMVKETEKLHATVGRYKSPDEHPFFPDTLPEPLLPPLEYPQVLHPAADSININGQIWDMYFKNLLPRLVKEGHDGNCGSSATCDTICLQALSKRIHYGKFVAEAKFRESPDVYKAAIIAQDRDGLMDLLTYPEVEEVIRRRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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