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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003239`

染色体: Chr06 坐标: 45089431-45102529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003239`
名称	SmilChr06G003239
描述	phosphatidylinositol 4-kinase beta 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45089431 - 45102529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989952`
GeneID	`130989952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989952`
原始查询	`SmilChr06G003239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol 4-kinase beta 1-like
产物	phosphatidylinositol 4-kinase beta 1-like
Arabidopsis	`AT5G64070` (PI-4KBETA1) phosphatidylinositol 4-OH kinase beta1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836528] identity=64.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0209700` (OsPI4K1) - identity=59.2; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004430 (1-phosphatidylinositol 4-kinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016020 (membrane); GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process); GO:0048015 (phosphatidylinositol-mediated signaling)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00454 (PI3_PI4_kinase); PF21245 (PI4KB-PIK1_PIK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057770114.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057770114.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057770114.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770114.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45090320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B68,B69,C38
`Chr6:45096573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:45096967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C73,C83
`Chr6:45096993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr6:45097012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C11,C69
`Chr6:45097137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr6:45097194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:45098968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr6:45100872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B13
`Chr6:45100987`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr6:45100987`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr6:45100992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770114.1

1188 aa

594

1188

PI4KB-PIK1_PIK

PI3_PI4_kinase

PF21245 PI4KB-PIK1_PIK 50-120 aa PF00454 PI3_PI4_kinase 927-1134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770114.1`	Pfam	`PF21245`	PI4KB-PIK1_PIK	Repeat	50	120	2.8e-12	47.3	PI4KB/PIK1, accessory (PIK) domain
`XP_057770114.1`	Pfam	`PF00454`	PI3_PI4_kinase	Family	927	1134	6.3e-39	135.0	Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914131.1
GAAAAATATGCCTTCGCCGTCACTCTCCCCACTCGAAACTTGAAAAGAAAAAAATTAAATTAAGAGGAATCCCCCCTCGGAGCACCCTCCGCGCACGTTAGCACCACCACCACCTCCTCCCACTTTTCTCCCCATTATACCCCTGGTGCCGGCCAATTTTGCGGCGCCGGTCGGAACCCCAATTTCCCAATTCCCTCTGTATATTTCATCTTTAATTCTGCGCCTGTGGGGATATCACTTCAAATTCTCAAAATTAGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989952
ATGGCGAGGCTACTGGGATTGACGCGTGCCTTCGGCGAGTGGGCTGAGTCACCTCGCGAGGTGACGCGGACGATTCCGACCAGTGAGAGCATCGGTGAGAGCGGGTGGCTGATTAGGTTCTTCGATTCGGCGTTTTTCTGCGAATGGATCGCGGTCAGCTACCTCTACAAGCACGATCATCCTGGGGTGCGGGATTACTTGTGCAACCGGATGTACACTCTACCTCTCTCCGGCATCGAGAGCTACTTGTTTCAAATTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770114.1
MARLLGLTRAFGEWAESPREVTRTIPTSESIGESGWLIRFFDSAFFCEWIAVSYLYKHDHPGVRDYLCNRMYTLPLSGIESYLFQICYMLIHKPSPSLDKFVIDICSRSLKIALKVHWFLMAELEDVDDNEGISRIQEKCQFAATLMGEWPPLIKPQTWSSGFMSSSSNINSSSSSPIGKNQVLNRLFSSKQKLLSLTSSPPSSTSASRSFSFSPSSGNSISQDDGGKVVGSPDESNKIFKKFIPGAKVRDALLFRKSGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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