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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000205`

染色体: Chr07 坐标: 1290993-1293497 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000205`
名称	SmilChr07G000205
描述	uncharacterized SmilChr07G000205
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1290993 - 1293497 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991406`
GeneID	`130991406`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991406`
原始查询	`SmilChr07G000205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415]; symbol=AT5G62950; hit=AT5G62950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415]; symbol=AT5G62950; hit=AT5G62950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G62950` (AT5G62950) RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415] identity=50.4; qcov=0.885; evalue=4.66e-42; confidence=medium
Rice	`Os12g0488800` - identity=51.1; qcov=0.586; evalue=1.04e-26; confidence=medium
GO	GO:0000166 (nucleotide binding); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006384 (transcription initiation at RNA polymerase III promoter)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03874 (RNA_pol_Rpb4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991406

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771600.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771600.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771600.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771600.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1291227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:1291287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:1291298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C86
`Chr7:1291300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B78,D11
`Chr7:1291307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B88,C58,C78,D10
`Chr7:1291370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B28,B48
`Chr7:1292597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C16,D2
`Chr7:1292625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B20,B35,C86
`Chr7:1292649`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B20,B77,C22
`Chr7:1292700`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A3,A6,B125,B140,B29,B3,B36,B50,B56,B62,B66,B68,B78,C28,C33,C34,C48,C55,C58,C59,C74,D11,D3
`Chr7:1292706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B56,C55,C74
`Chr7:1292717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B77,C22,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771600.1

157 aa

157

RNA_pol_Rpb4

PF03874 RNA_pol_Rpb4 10-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771600.1`	Pfam	`PF03874`	RNA_pol_Rpb4	Family	10	118	2.5e-12	47.8	RNA polymerase Rpb4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915617.1
GCGCGCGGTGCGACGCAAAAAGCGTGTCGATCCGGGGTGAAAATCGCCGCATTGGAGATGCTCTAACGAAACATATTTATTTAATTTAATTATAATTTGTATTTTATTATTCTAAATTTATAATTGAGTACTAATTTCTAATTGGAATGGAAGCCCTAAACCCCCAATTCTAAATTTCTAATTCAGTGAATTCAGTCAATTCACGCACAGACGCACTCTCATCTCTCTCTCTCGAACTCGGTTGCCGGCGCCGCCGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991406
ATGAAAGTAGTTGAGGCCAGTGCCGGTGCTCTCACTAATTTCGAAGTTCTTGACCTTTTGAGATCAAGAGGAGCTGGAAAGGATGCGTCTCGAGCTATTGCAACCGTATCTCAATCTGAGTTCAAGGTTTTTGATTATCTAGAGGGGACTGTTGCTTGCAATCAAACAAGGGAGATTATTGATAACTTTGTTGAAGAGTGTCAAAAATTTGACCTGGCCAAGGCAGAGATTCTTAATATTGTGAATATAAGACCAAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771600.1
MKVVEASAGALTNFEVLDLLRSRGAGKDASRAIATVSQSEFKVFDYLEGTVACNQTREIIDNFVEECQKFDLAKAEILNIVNIRPRSEPELFPFIEECESEPCMEDKAKELIETITRVLPPHPSQVDEANDEAAEGEETDGEAAEGDEEIEPEPNTT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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