当前解析结果
SmilChr07G000269| 统一基因 ID | SmilChr07G000269 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000269 |
| 描述 | lactoylglutathione lyase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 1734065 - 1736743 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991466 |
|---|---|
| GeneID | 130991466 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130991466 |
| 原始查询 | SmilChr07G000269 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | lactoylglutathione lyase-like |
| 产物 | lactoylglutathione lyase-like |
| 拟南芥 | AT2G32090 (AT2G32090)Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817769] identity=59.85; qcov=0.903; evalue=6.26e-58; confidence=high |
| 水稻 | Os03g0659300 (OsGLYI4)- identity=51.52; qcov=0.89; evalue=6.69e-39; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00903 (Glyoxalase); PF13669 (Glyoxalase_4); PF18029 (Glyoxalase_6) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991466 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057771690.1 |
| 2 | 细胞质 | 0.40000 | XP_057771691.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:1734344 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B107,B119,B130,B133,C25,C30,D9 |
Chr7:1735038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B98 |
Chr7:1735176 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,B54 |
Chr7:1735230 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B30,B31,C12 |
Chr7:1735242 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B139,B54,C15 |
Chr7:1736330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr7:1736338 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr7:1736467 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B103,B13,B2,C39,C60,D4 |
Chr7:1736475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,C14,C38,C62 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771690.1PF00903
Glyoxalase 12-134 aa
PF13669
Glyoxalase_4 13-127 aa
XP_057771691.1PF00903
Glyoxalase 12-138 aa
PF13669
Glyoxalase_4 13-127 aa
PF18029
Glyoxalase_6 18-138 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771690.1 |
Pfam | PF00903 |
Glyoxalase | Domain | 12 | 134 | 2e-11 | 45.1 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
XP_057771690.1 |
Pfam | PF13669 |
Glyoxalase_4 | Family | 13 | 127 | 5.9e-09 | 36.9 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
XP_057771691.1 |
Pfam | PF00903 |
Glyoxalase | Domain | 12 | 138 | 3.9e-13 | 50.6 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
XP_057771691.1 |
Pfam | PF13669 |
Glyoxalase_4 | Family | 13 | 127 | 5.5e-09 | 37.0 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
XP_057771691.1 |
Pfam | PF18029 |
Glyoxalase_6 | Domain | 18 | 138 | 3.4e-05 | 25.2 | Glyoxalase-like domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。