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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000309`

染色体: Chr07 坐标: 2030312-2036751 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000309`
名称	SmilChr07G000309
描述	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2030312 - 2036751 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991504`
GeneID	`130991504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991504`
原始查询	`SmilChr07G000309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
产物	probable linoleate 9S-lipoxygenase 5
Arabidopsis	`AT3G22400` (LOX5) PLAT/LH2 domain-containing lipoxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821808] identity=65.1; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0700700` (OsLOX1) - identity=59.5; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016702 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen); GO:0034440 (lipid oxidation); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil00591 (Linoleic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00305 (Lipoxygenase); PF01477 (PLAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057771740.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771740.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771740.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057771740.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057771740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2030584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B107,B121,B18,B73
`Chr7:2030865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B50,C30,C34,D3
`Chr7:2030878`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr7:2030878`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr7:2031061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:2031193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:2031238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B35
`Chr7:2033446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:2033467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:2033701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B93,B94,C33
`Chr7:2033780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B1,B74,C27
`Chr7:2033780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B74,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771740.1

886 aa

443

886

PLAT

Lipoxygenase

PF01477 PLAT 72-177 aa PF00305 Lipoxygenase 192-864 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771740.1`	Pfam	`PF01477`	PLAT	Domain	72	177	3.4e-17	63.9	PLAT/LH2 domain
`XP_057771740.1`	Pfam	`PF00305`	Lipoxygenase	Domain	192	864	3.2e-299	994.9	Lipoxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915757.1
ACAGCAGCTGCTTCTCCACACACACAGATTTCCCCACTTTTTCTCACATTCTACTATCATAATACATATACCCACTAATCTAAACACGTAATTAGCATTAATTACATCGAATCTTCTCACACTTTACTTAACCCCCCCATCATAATCACCCACTCAAGCAAGGCATAATTTCCAACTGAAAATCCCCCATCGTCAACTAATTTCTTCCTATTCCACTTTCCCCCCCTTTTTCGCAATGTCGTGTAATTGCTCAGAGATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991504
ATGTCGTGTAATTGCTCAGAGATGTGGGAGAATTTACTGGGCTGCTTGTGCGGAGAGATCAAAGATTCGCCCAAAATCGAGCAGCAGCAGCAGCAGAAGAAGAAGATCAAAGGCATTGTCGTGTTGAAGAAGAAGAATGTGATGGACGTCACCGACGTCGGCGCCTCCTTGCTCGACCGCATCCACGAGCTCTTCGGCAAAGGCGTTTCTCTGCAGCTCGTCAGCTCTCATTCCGCTGAGCCAGGAAACTCGAGAAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771740.1
MSCNCSEMWENLLGCLCGEIKDSPKIEQQQQQKKKIKGIVVLKKKNVMDVTDVGASLLDRIHELFGKGVSLQLVSSHSAEPGNSRKGKVGKEAYLEDWLPKLTSLNAEDHASFNVTFDWDVESLGFPGALIVKNQHHSQLYLKSVALENVCGYGRVDFVCDSWVYPVRRYKYDRVFFASKTYLPGETPEPLLFYREQELRSLRGEDRLEGSGMLKEWDRVYDYAYYNDLGAPEKGEEYARPVLGGPDYPYPRRARTGRPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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