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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000317`

染色体: Chr07 坐标: 2113920-2118985 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G000317`
名称	SmilChr07G000317
描述	long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2113920 - 2118985 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991509`
GeneID	`130991509`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130991509`
原始查询	`SmilChr07G000317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal-like
产物	long chain acyl-CoA synthetase 6%2C peroxisomal-like
拟南芥	`AT5G27600` (LACS7) long-chain acyl-CoA synthetase 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832820] identity=68.42; qcov=0.996; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os12g0143900` (LACS7) - identity=68.09; qcov=0.996; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0004467 (long-chain fatty acid-CoA ligase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991509

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质基质	0.60000	`XP_057771749.1`
2	内质网	0.20000	`XP_057771749.1`
3	脂滴	0.20000	`XP_057771749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2115095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C60
`Chr7:2115104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C9,D1
`Chr7:2115325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,A6
`Chr7:2115651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B24,B58,B71
`Chr7:2115698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B33,D11
`Chr7:2116017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B97,C1
`Chr7:2116041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,B97,C60,D10
`Chr7:2116458`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:2116458`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:2116460`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B88
`Chr7:2116460`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B88
`Chr7:2116588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771749.1

672 aa

336

672

AMP-binding

PF00501 AMP-binding 94-494 aa

XP_057771750.1

671 aa

336

671

AMP-binding

PF00501 AMP-binding 94-494 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057771749.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	94	494	1.9e-88	297.6	AMP-binding enzyme
`XP_057771750.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	94	494	1.9e-88	297.6	AMP-binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915766.1
ACACACACACACACACACATACAATAACTCAAAATCTAGTTTATTGCATACTATAATAAGATGTCCATATCAATGGCGATTTACTGTTGATGTAGTGACAAACGAAAACTCCATATCACTACATATTCCCCATGCCGCCATTCATCCCTCTCTTCACTTTCCTTCTTCGTTTATCAACATTTGCACCTCAAAAATAACCATGGATTCCCAACGCCGTCTCCACACACTTACTAATCATCTCATCAACTCCACCGCTGCCG...

XM_057915767.1
TACTATAATAAGATGTCCATATCAATGGCGATTTACTGTTGATGTAGTGACAAACGAAAACTCCATATCACTACATATTCCCCATGCCGCCATTCATCCCTCTCTTCACTTTCCTTCTTCGTTTATCAACATTTGCACCTCAAAAATAACCATGGATTCCCAACGCCGTCTCCACACACTTACTAATCATCTCATCAACTCCACCGCTGCCGCAGAATTCGTTTCAGAGAAAGGATACAGTGTTGTGCTTCCGGAGAAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771750.1_34778
ATGGATTCCCAACGCCGTCTCCACACACTTACTAATCATCTCATCAACTCCACCGCTGCCGCAGAATTCGTTTCAGAGAAAGGATACAGTGTTGTGCTTCCGGAGAAACTGCAGAGTGGGGAATGGAATGTCTACAGAAATGGGCGATCGCCTTTGAAACTTGTTAGTAGATTTGTTGATCATCCTGAGATTGCTACTTTACATGACAATTTTGTGCATGCTGTTGAGACATTCCGGGATTACAAGTATTTAGGAACGCG...

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771749.1_34779
ATGGATTCCCAACGCCGTCTCCACACACTTACTAATCATCTCATCAACTCCACCGCTGCCGCAGAATTCGTTTCAGAGAAAGGATACAGTGTTGTGCTTCCGGAGAAACTGCAGAGTGGGGAATGGAATGTCTACAGAAATGGGCGATCGCCTTTGAAACTTGTTAGTAGATTTGTTGATCATCCTGAGATTGCTACTTTACATGACAATTTTGTGCATGCTGTTGAGACATTCCGGGATTACAAGTATTTAGGAACGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771749.1
MDSQRRLHTLTNHLINSTAAAEFVSEKGYSVVLPEKLQSGEWNVYRNGRSPLKLVSRFVDHPEIATLHDNFVHAVETFRDYKYLGTRFQEDGTVGEYRWITYGEAGTSRSAIGSSLVRRCIQKGSCVGLYFVNRPEWVVVDHACSAYSFVSVPLYDTLGPEAVRYIVNHAAVRAIFCDSKTFNILLSFLSELPSVELIVVVGGVEGEMAPLPSTKQVEIISYSQLLSEGLSCIQPFCPPNSDDIATICYTSGTTGTPKGV...

XP_057771750.1
MDSQRRLHTLTNHLINSTAAAEFVSEKGYSVVLPEKLQSGEWNVYRNGRSPLKLVSRFVDHPEIATLHDNFVHAVETFRDYKYLGTRFQEDGTVGEYRWITYGEAGTSRSAIGSSLVRRCIQKGSCVGLYFVNRPEWVVVDHACSAYSFVSVPLYDTLGPEAVRYIVNHAAVRAIFCDSKTFNILLSFLSELPSVELIVVVGGVEGEMAPLPSTKQVEIISYSQLLSEGLSCIQPFCPPNSDDIATICYTSGTTGTPKGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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