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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000324`

染色体: Chr07 坐标: 2174617-2182941 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G000324`
名称	SmilChr07G000324
描述	probable ATP-dependent DNA helicase CHR12
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2174617 - 2182941 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991520`
GeneID	`130991520`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130991520`
原始查询	`SmilChr07G000324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ATP-dependent DNA helicase CHR12
产物	probable ATP-dependent DNA helicase CHR12
拟南芥	`AT3G06010` (ATCHR12) SNF2/Brahma-type chromatin-remodeling protein CHR12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819772] identity=67.56; qcov=0.975; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os05g0144300` (CHR719) - identity=62.44; qcov=0.971; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0042393 (histone binding); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0140658 (ATP-dependent chromatin remodeler activity)
KEGG	-
Pfam	PF00176 (SNF2-rel_dom); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII); PF11496 (HDA2-3); PF14619 (SnAC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991520

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亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`XP_057771764.1`
2	染色体	0.20000	`XP_057771764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2174909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B93
`Chr7:2174946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:2174990`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B42,C58
`Chr7:2174990`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B42,C58
`Chr7:2175038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:2175112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B50,C21,C30,D3
`Chr7:2175136`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B104,B30,C13,C25,C28,C51,C73
`Chr7:2175138`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B104,B30,C13,C25,C28,C51,C73
`Chr7:2175233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:2175251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C61,C69
`Chr7:2175814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,B82,C20
`Chr7:2175840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771764.1

1096 aa

548

1096

ResIII

SNF2-rel_dom

HDA2-3

Helicase_C

SnAC

PF04851 ResIII 414-576 aa PF00176 SNF2-rel_dom 418-706 aa PF11496 HDA2-3 680-864 aa PF00271 Helicase_C 725-838 aa PF14619 SnAC 931-994 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057771764.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	414	576	2.5e-10	41.2	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057771764.1`	Pfam	`PF00176`	SNF2-rel_dom	Domain	418	706	6.8e-95	318.2	SNF2-related domain
`XP_057771764.1`	Pfam	`PF11496`	HDA2-3	Domain	680	864	2.8e-10	40.5	Class II histone deacetylase complex subunits 2 and 3
`XP_057771764.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	725	838	4.4e-25	88.8	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057771764.1`	Pfam	`PF14619`	SnAC	Domain	931	994	2e-08	35.3	Snf2-ATP coupling, chromatin remodelling complex

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915781.1
CCCTTTCGCGCAAGCGTATAGAAACCCTTATCTCAGAATCGCAAAATCCTAAAATAATAGACCAAATCAAAAAAGATTTAAATGAAAAAAATAAAATTATTATCCCCCACGCCCGAATCGATCGATTTCGGATTCTAGATCCGCCAAAACAACCCGTTACAAATCAGAACTCTTCACTCCAATTTTTTCAAAAAACTGCGGCACGACGCCGTTTTCCTGCTCCCGCCATGGTCGCACAGGTGGCGGATCCCCAGCCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057771764.1_34788
ATGGTCGCACAGGTGGCGGATCCCCAGCCATCTGCGCCCCAGCAATTTCAGGCCGACCCCGACCCCCCGCCGCCGCTCGCCAGCGCCAAGACGCTCATCTGCGCCCTCAATTTCCTCTCCCGCAATCTGCCCCTGCCCCAGCATGTCTACGACGCCGTTTCCTCCATCTACGATGCCGACGAATTGCCCCTTGATGAAGTTGATTGTGACGCCAGCAACGGGGACGGGGGGGCTTCGCCGCTGCCCAAGGAAAAATTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771764.1
MVAQVADPQPSAPQQFQADPDPPPPLASAKTLICALNFLSRNLPLPQHVYDAVSSIYDADELPLDEVDCDASNGDGGASPLPKEKFGASTYNELMLDFEDAVLKQRSACLPSSKLSELKETRFQSQIKHRLTELEELPTSRGEDLQSKCLLELYGLKLAQLQSKVRSEVSSEYWLRLYCANPDKQLFDWGMMRLRRPLFGIGDAFSMETDDPLKKKREAERFSRFEEEEKNRIETRKRKFFADLLNAARELQLQVQAAQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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