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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000385`

染色体: Chr07 坐标: 2585593-2586724 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000385`
名称	SmilChr07G000385
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At5g41840
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2585593 - 2586724 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991585`
GeneID	`130991585`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991585`
原始查询	`SmilChr07G000385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box/LRR-repeat protein At5g41840
产物	putative F-box/LRR-repeat protein At5g41840
Arabidopsis	`AT1G60410` (AT1G60410) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842336] identity=26.4; qcov=0.779; evalue=2.83e-12; confidence=low
Rice	`Os07g0285700` (OsFbox364) - identity=26.6; qcov=0.594; evalue=5.23e-06; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991585

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771858.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771858.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771858.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771858.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2585725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:2585728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:2585833`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	211	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B122,B125,B126,B127,B129,B13,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr7:2585834`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	211	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B122,B125,B126,B127,B129,B13,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr7:2585882`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C52
`Chr7:2585882`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C52
`Chr7:2585904`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	61	A11,A14,A16,A18,A20,A24,A5,A9,B1,B105,B107,B113,B114,B117,B119,B12,B125,B126,B127,B130,B133,B138,B139,B15,B19,B22,B27,B38,B41,B42,B43,B55,B70,B72,B75,B78,B83,B84,C1,C10,C11,C22,C28,C29,C36,C37,C4,C40,C43,C5,C56,C59,C6,C69,C79,C83,C85,C9,D4,D8,D9
`Chr7:2585908`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	61	A11,A14,A16,A18,A20,A24,A5,A9,B1,B105,B107,B113,B114,B117,B119,B12,B125,B126,B127,B130,B133,B138,B139,B15,B19,B22,B27,B38,B41,B42,B43,B55,B70,B72,B75,B78,B83,B84,C1,C10,C11,C22,C28,C29,C36,C37,C4,C40,C43,C5,C56,C59,C6,C69,C79,C83,C85,C9,D4,D8,D9
`Chr7:2585954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B40
`Chr7:2586049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:2586090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C2,C27,C46
`Chr7:2586119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B101,B107,B135,B40,B85,B93,C18,C2,C27,C4,C51,C64,C66,C69,C7,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771858.1

335 aa

168

335

LRR_At5g56370

PF24758 LRR_At5g56370 110-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771858.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	110	194	6.4e-15	56.1	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915875.1
AGCCTAAAAAATCATCCAAAATTTGGAGTTGTTCCGATGGAGAATGCTGCTGACCTCTCTCCGCTCCCAGAAGAAATCATTCACCGCATACAATCTCTTCTGCTGCATGAAAGAGATGCTGCTCAGACCTCTCTCCTATCCAAGTCCTGGCACGACGCGTGGACCACACGCCTCAACCTCACTTTCGATCAATACAAGTTCCGGAATCGCGTGAATGAGTTTCCCATATTCACGAGGAAGATCATGCAGAGGTATGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991585
ATGGAGAATGCTGCTGACCTCTCTCCGCTCCCAGAAGAAATCATTCACCGCATACAATCTCTTCTGCTGCATGAAAGAGATGCTGCTCAGACCTCTCTCCTATCCAAGTCCTGGCACGACGCGTGGACCACACGCCTCAACCTCACTTTCGATCAATACAAGTTCCGGAATCGCGTGAATGAGTTTCCCATATTCACGAGGAAGATCATGCAGAGGTATGAAGATTTGAACCGAAATATTAAGAGTTTCAAGCTATTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771858.1
MENAADLSPLPEEIIHRIQSLLLHERDAAQTSLLSKSWHDAWTTRLNLTFDQYKFRNRVNEFPIFTRKIMQRYEDLNRNIKSFKLLMKGNDDSDLARELILKAIKLGATDLTLQFSISDTNRCFVLPDEVLESKTLVRLYVLGLTVDLERRNKAVACSNLKYLWLSQASVKGDLIRDLISRCPSIEELTLFHTSLFGYERRRWSPSHDHQFDNLKCLRLICLGVKLHDHDELWNNSPSLKVLVIWDENSDYVRICSPSLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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