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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000398`

染色体: Chr07 坐标: 2750757-2756142 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000398`
名称	SmilChr07G000398
描述	callose synthase 11-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2750757 - 2756142 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991593`
GeneID	`130991593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991593`
原始查询	`SmilChr07G000398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	callose synthase 11-like
产物	callose synthase 11-like
Arabidopsis	`AT4G04970` (GSL1) glucan synthase-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825838] identity=68.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0754200` (OsGSL3) - identity=64.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000148 (1,3-beta-D-glucan synthase complex); GO:0003843 (1,3-beta-D-glucan synthase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006075 ((1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF02364 (Glucan_synthase); PF14288 (FKS1_dom1); PF25968 (CALS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771868.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771868.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771868.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771868.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2751086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:2751207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C78,C85
`Chr7:2751468`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr7:2751468`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr7:2751612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C78,C85
`Chr7:2752576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:2753593`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C11
`Chr7:2753593`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C11
`Chr7:2754167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:2754230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B53
`Chr7:2754253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:2754420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771868.1

1769 aa

884

1769

FKS1_dom1

CALS1

Glucan_synthase

PF14288 FKS1_dom1 159-271 aa PF25968 CALS1 683-864 aa PF02364 Glucan_synthase 873-1667 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771868.1`	Pfam	`PF14288`	FKS1_dom1	Family	159	271	1.7e-42	144.9	1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1
`XP_057771868.1`	Pfam	`PF25968`	CALS1	Domain	683	864	9.5e-25	88.1	Callose synthase 1 domain
`XP_057771868.1`	Pfam	`PF02364`	Glucan_synthase	Family	873	1667	1.9e-259	863.9	1,3-beta-glucan synthase component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915885.1
ATTCGAATACATATTTATCCACAAAAACAATAATTGATTCACCTTTTCTTTTTGAGTGTTGAAACAGTTGGATGCCATGAATCTGAGGCAGCGACAGCCTCCCACGCGCGGCCGTGGGCCTCAGCCTCCACCACCTCCACCGCAGCTGTTGTCGGAGCCCTTCAACATCATTCCAATACACAACCTTCTCCTGGACCACCCCTCCCTCCGCTTCCCAGAGGTACGCGCCGCCGCCGCCGCCTTGCGCTCAGCCGGCGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991593
ATGAATCTGAGGCAGCGACAGCCTCCCACGCGCGGCCGTGGGCCTCAGCCTCCACCACCTCCACCGCAGCTGTTGTCGGAGCCCTTCAACATCATTCCAATACACAACCTTCTCCTGGACCACCCCTCCCTCCGCTTCCCAGAGGTACGCGCCGCCGCCGCCGCCTTGCGCTCAGCCGGCGACCTCCGCAAACCGCCGTTCAACCCATGGCACGACTCCATGGACCTCCTAGACTGGCTCGGCTCGTTCTTCGGCTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771868.1
MNLRQRQPPTRGRGPQPPPPPPQLLSEPFNIIPIHNLLLDHPSLRFPEVRAAAAALRSAGDLRKPPFNPWHDSMDLLDWLGSFFGFQMDNVRNQREHLVLHLANSQMRLPSAPDRLDGGVLRRFRVKLLKNYDSWCSYLGKRSQVRLPSRHNPDLERRELLYVCLYLLIWGEAANLRFLPECLCYIYHHMALELNFILDDHVDETTAQLFVPSTCKQFGFLDYVVKPIYTTIKGEAARSRNGTAPHSAWRNYDDINEYFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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