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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000422`

染色体: Chr07 坐标: 2942584-2944248 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000422`
名称	SmilChr07G000422
描述	F-box/LRR-repeat protein At5g02910-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2942584 - 2944248 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991619`
GeneID	`130991619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991619`
原始查询	`SmilChr07G000422`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At5g02910-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At5g02910-like
Arabidopsis	`AT3G03030` (AT3G03030) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821153] identity=31; qcov=0.457; evalue=7.02e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771910.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771910.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771910.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771910.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2942895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:2942901`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	71	A16,A18,A22,A24,A3,A9,B101,B102,B11,B114,B120,B124,B132,B14,B140,B16,B17,B21,B22,B28,B29,B31,B33,B42,B43,B47,B5,B50,B51,B52,B53,B58,B59,B60,B61,B65,B69,B70,B80,B86,B87,B89,B92,B93,C13,C14,C17,C18,C24,C30,C31,C36,C41,C44,C45,C49,C52,C53,C56,C57,C59,C6,C65,C67,C7,C75,C76,C82,C84,D11,D4
`Chr7:2942943`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	237	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr7:2942945`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	195	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B112,B117,B119,B12,B121,B123,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B90,B91,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C32,C34,C35,C38,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D6,D7,D9
`Chr7:2942948`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	149	A10,A16,A18,A19,A21,A23,A24,A3,A5,A6,A7,B100,B101,B102,B103,B104,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B118,B121,B122,B123,B124,B129,B13,B130,B135,B136,B138,B139,B15,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B36,B37,B38,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B50,B51,B53,B58,B6,B61,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B74,B76,B79,B80,B85,B86,B87,B9,B93,B94,B97,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C2,C22,C23,C25,C26,C29,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C56,C57,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C81,C84,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D8
`Chr7:2942960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr7:2943005`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B43
`Chr7:2943005`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B43
`Chr7:2943025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A23,B1,B103,D6
`Chr7:2943074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr7:2943118`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B133,B9
`Chr7:2943118`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B133,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771910.1

438 aa

219

438

F-box

PF00646 F-box 3-37 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771910.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	3	37	9.7e-05	22.8	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915927.1
GATATATAGCACTAAAACTAAAACAAAAGCTTCAAATATTCGAAATTAAAATTATGGCTCATCTTCCTGGCGATATTATTCAGTGCATACAATCTCTTCTCACTCCAAAAGAAGCTGCTCGAACCTCTCTCGTATCCAAGTCATGGTACGGCGCGTGGGCCACAACCCCCAATCTCAGATTCTTTGAATACGAGTCGCGAAAATGGTTTCCGCAATTCACGAAGAAGACGCTGCAGAGGTATGAAGATCTCAATCTAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991619
ATGGCTCATCTTCCTGGCGATATTATTCAGTGCATACAATCTCTTCTCACTCCAAAAGAAGCTGCTCGAACCTCTCTCGTATCCAAGTCATGGTACGGCGCGTGGGCCACAACCCCCAATCTCAGATTCTTTGAATACGAGTCGCGAAAATGGTTTCCGCAATTCACGAAGAAGACGCTGCAGAGGTATGAAGATCTCAATCTAAAGATCCAAAGTTTCGGTCTATTTATGTACCAAAAACATTCTCTGGCTAGAGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771910.1
MAHLPGDIIQCIQSLLTPKEAARTSLVSKSWYGAWATTPNLRFFEYESRKWFPQFTKKTLQRYEDLNLKIQSFGLFMYQKHSLARELILKAIELGAADLRIYVAEDNHAPFVLPDEVLASQTLTRLSASRCRIDLGRRKKEVIPCSALKSLNLSCATVNDDFFKDLSWRFPRIEELTLKEPKRLLRRELVFDVAAMVKLHKLKSLRLDWLGVRDCLSKHDLWPQFPCLKELVLKLIQNFEYSDIRICSPSLERIVIDLSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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