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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000591`

染色体: Chr07 坐标: 4029489-4031613 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000591`
名称	SmilChr07G000591
描述	uncharacterized SmilChr07G000591
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4029489 - 4031613 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991934`
GeneID	`130991934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991934`
原始查询	`SmilChr07G000591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsHIGD4; symbol=OsHIGD4; hit=Os02g0592400; species=rice; confidence=medium
产物	OsHIGD4; symbol=OsHIGD4; hit=Os02g0592400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G27760` (AT5G27760) Hypoxia-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832838] identity=72.2; qcov=0.99; evalue=7.3e-34; confidence=medium
Rice	`Os02g0592400` (OsHIGD4) - identity=67; qcov=0.898; evalue=1.34e-40; confidence=medium
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0005746 (GO:0005746); GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	-
Pfam	PF04588 (HIG_1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772374.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057772374.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057772374.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772374.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4029914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:4031218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,C58
`Chr7:4031394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:4031410`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	99	A11,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A24,A25,B103,B105,B108,B109,B112,B113,B114,B115,B118,B120,B121,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B137,B138,B15,B18,B2,B20,B22,B25,B28,B30,B37,B40,B41,B42,B43,B48,B49,B59,B63,B64,B66,B67,B71,B73,B78,B79,B8,B82,B84,B86,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,C10,C11,C15,C16,C18,C20,C21,C27,C28,C3,C32,C36,C42,C43,C48,C5,C50,C52,C57,C68,C69,C7,C71,C72,C76,C83,C85,C87,D11,D2,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772374.1

98 aa

HIG_1_N

PF04588 HIG_1_N 17-67 aa

XP_057772375.1

98 aa

HIG_1_N

PF04588 HIG_1_N 17-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772374.1`	Pfam	`PF04588`	HIG_1_N	Family	17	67	5.7e-15	56.0	Hypoxia induced protein conserved region
`XP_057772375.1`	Pfam	`PF04588`	HIG_1_N	Family	17	67	5.7e-15	56.0	Hypoxia induced protein conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916392.1
TTACAATTTTTGAAATTCCAATATTGGGCTTAAAATTGGGCCCAACACGTTGCAATAACTTGTGCTGGTGGAATTCCTGTTTTGCAGCAGCGCTTTACAAATTGCAATTCTCTTCTGATAAAAAAACCCTTTTTTTATTAATACACATTATTTAAAAACTTAGAAGCGGAAAAGAGAAAAAGGTTGAGAGAAAATCAAGAAAATGGGAGAAGAAAAAGGCAAGATTCAAGCTTTGAGGGAATGGGTTGTGGAGCACAAGC...

XM_057916391.1
CAACACGTTGCAATAACTTGTGCTGGTGGAATTCCTGTTTTGCAGCAGCGCTTTACAAATTGCAATTCTCTTCTGATAAAAAAACCCTTTTTTTATTAATACACATTATTTAAAAACTTAGAAGCGGAAAAGAGAAAAAGGTTGAGAGAAAATCAAGAAAATGGGAGAAGAAAAAGGCAAGATTCAAGCTTTGAGGGAATGGGTTGTGGAGCACAAGCTTCGTACTGTTGGGACTCTGTGGGCGAGTGGGATTGTGGGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991934
ATGGGAGAAGAAAAAGGCAAGATTCAAGCTTTGAGGGAATGGGTTGTGGAGCACAAGCTTCGTACTGTTGGGACTCTGTGGGCGAGTGGGATTGTGGGTTCAATGGCATACAATTGGTCTCAGCCTAATATGAAGACAAGCGTCAAGATCATTCATGCTAGGTTGCACGCTCAAGCACTCACACTCGCTGCATTGGCTGGGGCTGCGGTTGTCGAGTACTACGACCACAAGTCAGGAGCAAAAACAGAACGAGTTGCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772374.1
MGEEKGKIQALREWVVEHKLRTVGTLWASGIVGSMAYNWSQPNMKTSVKIIHARLHAQALTLAALAGAAVVEYYDHKSGAKTERVAKFLDLNENRHKN

XP_057772375.1
MGEEKGKIQALREWVVEHKLRTVGTLWASGIVGSMAYNWSQPNMKTSVKIIHARLHAQALTLAALAGAAVVEYYDHKSGAKTERVAKFLDLNENRHKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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