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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000689`

染色体: Chr07 坐标: 4709275-4713444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000689`
名称	SmilChr07G000689
描述	chaperonin CPN60, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4709275 - 4713444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991798`
GeneID	`130991798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991798`
原始查询	`SmilChr07G000689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperonin CPN60, mitochondrial
产物	chaperonin CPN60%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G23990` (HSP60) heat shock protein 60 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821983] identity=91.4; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0462900` - identity=87.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0042026 (protein refolding); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057772185.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057772185.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772185.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772185.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4709532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B36,C28
`Chr7:4709537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C48
`Chr7:4709569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:4709589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C45,C64,C66
`Chr7:4710174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B118,B95,C45,C83
`Chr7:4710387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B68,B71,B73
`Chr7:4710693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr7:4711323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,B8,C47
`Chr7:4711327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B125,B44,C2,C60
`Chr7:4711542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:4711945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B68,B71
`Chr7:4712200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772185.1

579 aa

290

579

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 54-556 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772185.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	54	556	5.6e-70	237.1	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916202.1
ATAGTAAAGAAAAAAAAAAGGTAGATACATGAAGGAAGAAGCTTAAACCCTTTAAGTGAGAGGGAGCCGTCGCATAAACCCTAGAAGATGCAACCTTCCTATATCTTCTAGACTCTTCTCAGTTTTCATTTAAAGCACACACAATACGCACCAGCTCTCTCAACTCTCTCTCTCTACACGCAGTAAACCCTCTCAACTCAACAATTCAATTTGTTTGCTTTGTTGCGCTACTCACTGCGTCAAAATATGTATCGATTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991798
ATGTATCGATTTGCAGCAAATCTCGCCTCCAAAGCCAGGGTTGCGAGGAACAGCAGCCAACAGATTGGTGGTAGATTGGGATGGAGTAGAAATTATGCTGCTAAAGATATTAGATTTGGAGTTGAGGCTAGGGCTTTGATGCTTAAGGGTGTTGAAGAGCTTGCTGATGCTGTTAAAGTCACCATGGGTCCTAAGGGGCGTAATGTAGTGATTGAGCAAAGTTGGGGTGCCCCCAAAGTGACAAAGGATGGTGTCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772185.1
MYRFAANLASKARVARNSSQQIGGRLGWSRNYAAKDIRFGVEARALMLKGVEELADAVKVTMGPKGRNVVIEQSWGAPKVTKDGVTVAKSIEFKDKVKNIGASLVKQVANATNDVAGDGTTCATVLTRAIFAEGCKSVAAGMNAMDLRRGISMAVDAVVTNLKSRARMISTSEEIAQVGTISANGEREIGELIAKAMEKVGKEGVITIQDGKTLFNELEVVEGMKLDRGYISPYFITNQKTQKCELDDPLILIHEKKISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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