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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000702`

染色体: Chr07 坐标: 4836701-4839994 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000702`
名称	SmilChr07G000702
描述	beta-amylase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4836701 - 4839994 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991799`
GeneID	`130991799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991799`
原始查询	`SmilChr07G000702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amylase 1, chloroplastic
产物	beta-amylase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G23920` (BAM1) beta-amylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821975] identity=74; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0141200` (OsBamy2) - identity=68; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772186.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057772186.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057772186.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772186.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4837083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:4837109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr7:4837117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C8
`Chr7:4837127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C27,C83
`Chr7:4837262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:4837268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:4837319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B97,C28,C52
`Chr7:4837352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:4837402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:4837430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C32,C68
`Chr7:4837468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C32,C68,D2
`Chr7:4837559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772186.1

576 aa

288

576

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 111-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772186.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	111	542	1.4e-178	595.1	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916203.1
GACGACAACCACTTCTCTCTCCTCACTCCTATAAATATAAATCCCCAATCGCCATTTCCTTCAGAGCTCAAAAAATTTAAAAAAAATATAAAATTCCTCTTCAACGGTGTTGTGATCAACGGTTTCAATCCAAATCTCTGTTAATAATTCCTACATATAATGGCAATGAGTTTGCCTCACCAGATTGGAGCGATTTCCGGCGCGCCGTTGGCGGGGGATTCCGGTTGCGTATCCGGTGAAGCGCCGTCTTCTGCTACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991799
ATGGCAATGAGTTTGCCTCACCAGATTGGAGCGATTTCCGGCGCGCCGTTGGCGGGGGATTCCGGTTGCGTATCCGGTGAAGCGCCGTCTTCTGCTACAGTCAGCGCGGTGTGGAGATCTCCCGCCGCATCTAACCTGCGCGTCTCCGCGATGGCGGAGTCCGACCGCATCTCCCCGTCGCCGCCGCTCAGCCCGCGCCTCGGCGGGGTGCGGCCGGACCTGTCGGTCGCGGCTCAGGCGCTGATGTCTCCGGCTACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772186.1
MAMSLPHQIGAISGAPLAGDSGCVSGEAPSSATVSAVWRSPAASNLRVSAMAESDRISPSPPLSPRLGGVRPDLSVAAQALMSPATEAIEDREYVAGGAPQAKDRKGVPVFVMMPLDSVTWNHTVNRKKAMNASLQALKSAGVEGIMMDVWWGLVEGEKPGEYNWGGYVELLEMAKKHGLKVQAVMSFHQCGGNVGDSCTIPLPKWVVEEIDKDPDLAYTDQWGRRNYEYLSLGCDTLPCLKGRTPVQCYSDFMRSFRDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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