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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000836`

染色体: Chr07 坐标: 5937321-5939868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000836`
名称	SmilChr07G000836
描述	transcription factor DIVARICATA
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5937321 - 5939868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992006`
GeneID	`130992006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992006`
原始查询	`SmilChr07G000836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor DIVARICATA
产物	transcription factor DIVARICATA
Arabidopsis	`AT5G58900` (AT5G58900) Homeodomain-like transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836007] identity=57.4; qcov=0.99; evalue=3.66e-112; confidence=high
Rice	`Os05g0449900` - identity=58.2; qcov=0.719; evalue=1.9e-76; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF23082 (Myb_DNA-binding_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772437.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772437.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772437.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772437.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5937613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B33,B53,C16,C2
`Chr7:5937713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D1
`Chr7:5937722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr7:5937724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:5937731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:5937917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B75
`Chr7:5937923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:5938561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:5938562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B26
`Chr7:5938563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:5938605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr7:5938683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B33,B53,C16,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772437.1

306 aa

153

306

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-binding_2

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 28-72 aa PF23082 Myb_DNA-binding_2 28-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 136-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772437.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	28	72	2.5e-22	79.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057772437.1`	Pfam	`PF23082`	Myb_DNA-binding_2	Domain	28	75	3.7e-11	43.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057772437.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	136	182	2.5e-22	79.4	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916454.1
TTCTTTTCTAATAAAAAAGAGACAGGAGCAGTGTGCATTATAATATGATACCTTTTTCATAAGTTGCAGTATCCACAAACACATTTCATCCAATCAAACTTCACCACCTTCCACTACCCCCCTCCACCCACCCCCCTCCCCTCCCTTTCTCTGTTGTTGGCTCTCTTGCCAGATCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCCTCTCTCTCTGTGTGTATGTTATGGTGGCAGGGTGAATTGAGATTCATTTTTTGAAGGCTTGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992006
ATGAGGTGGGACATGGAGATCTTATCACCAAGCTCGTATTTTTCGAATTCAAGCTGGCTGCTTGACGAGAGCAGGAGCACGCGGTGGACCGCCGCCGAGAACAAGCTCTTCGAGAATGCCCTCGCATTGTTCGACGAGAACACCCCCGACCGCTGGCAGAAGGTGGCGGCGATGGTGCCCGGAAAGACCGTCGGCGATGTGATTAGGCAGTATAAAGAATTGGAAGATGATGTGAGTAGTATTGAGGCAGGCCTCATCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772437.1
MRWDMEILSPSSYFSNSSWLLDESRSTRWTAAENKLFENALALFDENTPDRWQKVAAMVPGKTVGDVIRQYKELEDDVSSIEAGLIPVPGYTTSSPFTLEWGSAAHGYDGFKHSFAAGRKAPPPGRPSEQERKKGVPWTEEEHKLFLMGLKKYGKGDWRNISRNFVITRTPTQVASHAQKYFIRQLSGGKDKRRASIHDITTVNLNDHQAPSPERKKQPSPEQPSVLAPQLEKLPNYQWSQASNEAVMGFSSLCHGNMFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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