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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000884`

染色体: Chr07 坐标: 6320689-6324635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000884`
名称	SmilChr07G000884
描述	uncharacterized SmilChr07G000884
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6320689 - 6324635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992057`
GeneID	`130992057`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992057`
原始查询	`SmilChr07G000884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0297400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0297400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G30200` (EMB3147) EMBRYO DEFECTIVE 3147 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817570] identity=83; qcov=0.823; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0297400` - identity=82.3; qcov=0.818; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004314 ([acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase activity)
KEGG	smil00061 (Fatty acid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00698 (Acyl_transf_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992057

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772509.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057772509.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772509.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772509.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6321365`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C23
`Chr7:6321365`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C23
`Chr7:6321478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr7:6321998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:6322481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:6322485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B72
`Chr7:6322489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C82
`Chr7:6322513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B124,B128,B29,C15
`Chr7:6324275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr7:6324384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772509.1

407 aa

204

407

Acyl_transf_1

PF00698 Acyl_transf_1 106-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772509.1`	Pfam	`PF00698`	Acyl_transf_1	Domain	106	385	8e-27	95.3	Acyl transferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916526.1
CAAAAGGATAGCCGTTGGCCTAATTCCGCTTGACGGCATTTCTGAAGCTGCTTCTTCGTTTACTCCGCCAAACACTCCCTTATTTTGATGCATGCGCTTCTCCTCCACCACAACCACCGTTTCCCACTTCATCTCATTCGCTACACTCCTTCCTCAGCATTTTCCTCTCGCTCCGCCGCTATGAGTTCCGCAGTCACGCTCCCCTCGATTTCTCTCTCCAAATCCGCTTTCGGCGACCCCGATTCCTTCAGGAGCTCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992057
ATGCATGCGCTTCTCCTCCACCACAACCACCGTTTCCCACTTCATCTCATTCGCTACACTCCTTCCTCAGCATTTTCCTCTCGCTCCGCCGCTATGAGTTCCGCAGTCACGCTCCCCTCGATTTCTCTCTCCAAATCCGCTTTCGGCGACCCCGATTCCTTCAGGAGCTCCGTCTCTCTGGGGTTCAGAAATGAGATTCGGACGGTTTCACGGTTGAATTTGGAGAAATCTAGGGTTTTCATGAGCGTCGCCGTCGGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772509.1
MHALLLHHNHRFPLHLIRYTPSSAFSSRSAAMSSAVTLPSISLSKSAFGDPDSFRSSVSLGFRNEIRTVSRLNLEKSRVFMSVAVGSQTAVVDDALFKDYKPSTAFLFPGQGAQAVGMGVEAQKVPAAAELYKRANDILGFDLLDICISGPKEKLDSTVLSQPAIYVTSLAAVEVLRARDGGQQIIDSVDVTCGLSLGEYTALAFAGAFSFEDGLKLVKLRGEAMQDAADAAQSAMVSVIGLDSDKVQTLCDAANEDVDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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