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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000899`

染色体: Chr07 坐标: 6451096-6454192 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000899`
名称	SmilChr07G000899
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6451096 - 6454192 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992074`
GeneID	`130992074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992074`
原始查询	`SmilChr07G000899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4
Arabidopsis	`AT2G30300` (AT2G30300) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817580] identity=46.9; qcov=1.04; evalue=2.17e-139; confidence=high
Rice	`Os05g0475700` (OsMFS3) - identity=48.6; qcov=1.03; evalue=1.05e-165; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06813 (Nodulin-like); PF23262 (NFD4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057772529.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057772529.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772529.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772529.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6451310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B67,C17
`Chr7:6451372`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B45,B72,C14,C52
`Chr7:6451372`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B45,B72,C14,C52
`Chr7:6451465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B41,C13
`Chr7:6451498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B9
`Chr7:6451512`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A21,A5,B102,B106,B107,B108,B114,B115,B117,B13,B138,B139,B140,B15,B23,B29,B31,B35,B37,B45,B50,B51,B61,B65,B70,B74,B75,B76,B77,B8,B82,B85,B91,B92,B96,B97,C12,C13,C32,C39,C4,C43,C48,C49,C50,C51,C57,C60,C61,C63,C74,C75,C76,C78,C85,C9,D2
`Chr7:6451516`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	66	A20,A21,A22,A5,A7,B102,B106,B107,B108,B114,B115,B117,B13,B138,B139,B140,B15,B23,B29,B31,B35,B37,B45,B47,B50,B51,B52,B61,B65,B70,B74,B75,B76,B77,B8,B82,B85,B89,B91,B92,B93,B96,B97,C12,C13,C32,C39,C4,C43,C48,C49,C50,C51,C57,C58,C60,C61,C63,C66,C74,C75,C76,C78,C85,C9,D2
`Chr7:6451537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr7:6451540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C34
`Chr7:6451549`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	72	A20,A21,A22,A24,A5,A7,B107,B108,B114,B124,B139,B140,B15,B23,B24,B29,B31,B32,B35,B37,B38,B40,B45,B49,B50,B53,B56,B57,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B70,B76,B77,B8,B82,B91,B92,B93,B96,C12,C14,C18,C2,C25,C3,C32,C39,C4,C41,C43,C48,C49,C51,C57,C58,C61,C63,C71,C74,C75,C76,C78,C8,C85,C86,C9
`Chr7:6451585`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A21,A24,A7,B106,B107,B108,B114,B130,B131,B139,B140,B15,B23,B24,B29,B31,B32,B35,B37,B50,B53,B56,B57,B59,B61,B66,B77,B82,B86,B91,B93,B96,C14,C2,C3,C32,C39,C4,C43,C48,C49,C57,C58,C63,C71,C74,C75,C76,C78,C85,C86
`Chr7:6451588`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A21,A24,A5,A7,B106,B107,B108,B114,B130,B131,B139,B140,B15,B23,B24,B29,B31,B32,B35,B37,B50,B56,B57,B59,B61,B66,B77,B82,B91,B93,B96,C14,C2,C3,C32,C39,C4,C43,C48,C49,C57,C58,C63,C71,C74,C76,C78,C85,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772529.1

505 aa

252

505

Nodulin-like

NFD4_C

PF06813 Nodulin-like 4-249 aa PF23262 NFD4_C 289-501 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772529.1`	Pfam	`PF06813`	Nodulin-like	Domain	4	249	9.2e-68	229.2	Nodulin-like
`XP_057772529.1`	Pfam	`PF23262`	NFD4_C	Domain	289	501	6.2e-77	259.0	NFD4, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916546.1
AAGTAATTGTTTCTTTTACTTCTCTCCATTCATATATAACTATCAAAATTAATTAACCAAATCCATATGATTTTTACAAACCAAAAAAACTAAAAATAAAATCCCATTTCATATCAAACTCTTTTATTACAAGCTCGACAATTTTCTCAGCAAATATTCTGCAGCTGGAAGCTCTTCATAAATGCCTCTCCACTGGCTCGGCCTCGTCGCCGCCGTGTGGCTCCAATCCATCAACGGCACAAACTCAAACTTTCCGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992074
ATGCCTCTCCACTGGCTCGGCCTCGTCGCCGCCGTGTGGCTCCAATCCATCAACGGCACAAACTCAAACTTTCCGGCTTACTCCTCGGAGCTCAAGCGGATCCTCTCCATCTCGCAGCTCCAGCTCAACAACCTCGCCTTCGCCTCCGACGCCGGCAAGCTCCTCGGCTGGGTTTCCGGCGTCGCTGCCGCCCGCCTCCCGCTCTGGCTCGTCCTCCTCATCGGCTCCGCCCTCGGTGCTGCCGGATACGGAGTGCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772529.1
MPLHWLGLVAAVWLQSINGTNSNFPAYSSELKRILSISQLQLNNLAFASDAGKLLGWVSGVAAARLPLWLVLLIGSALGAAGYGVQFLFLTGRIHSLSYWQVFSLTVVAGNSICWINTVSYILAIRNFPLDRQIAVGISTSYVGLSAKIYTTVVEVAAASPSAPLERAKAFLLLNAALPLLVCVAAAPLTGYADVGKSRRLVAGFVTLFVITAVTGGFAVITSLIPRVLSPPAILIGLVVFLVLPLVTPAAEEIGEAVQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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