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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001117`

染色体: Chr07 坐标: 8280711-8281761 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001117`
名称	SmilChr07G001117
描述	cucumber peeling cupredoxin-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8280711 - 8281761 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992291`
GeneID	`130992291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992291`
原始查询	`SmilChr07G001117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cucumber peeling cupredoxin-like
产物	cucumber peeling cupredoxin-like
Arabidopsis	`AT3G17675` (AT3G17675) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008006] identity=40.5; qcov=0.689; evalue=3.19e-27; confidence=medium
Rice	`Os08g0482600` (OsUCL29) - identity=38.2; qcov=0.716; evalue=1.94e-23; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772840.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772840.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772840.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772840.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8281081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:8281087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr7:8281375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:8281382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:8281429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B3,C5,C73,D11
`Chr7:8281439`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	72	A13,A16,A19,A8,B10,B100,B105,B120,B121,B125,B131,B135,B136,B137,B19,B20,B21,B23,B24,B29,B35,B36,B38,B39,B42,B43,B47,B48,B53,B55,B64,B69,B7,B70,B72,B82,B9,B97,C23,C27,C28,C29,C31,C34,C36,C39,C4,C40,C41,C46,C52,C53,C55,C58,C59,C60,C61,C62,C66,C67,C69,C74,C75,C79,C8,C80,C82,C85,C87,C9,D5,D6
`Chr7:8281466`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B100,B110,B12,B121,B18,B55,B65,B83,C5,C63,C72,C76
`Chr7:8281499`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A11,A13,A15,A16,A19,A8,B10,B103,B113,B125,B126,B13,B131,B136,B14,B16,B19,B20,B23,B24,B27,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B42,B43,B47,B48,B51,B52,B53,B55,B56,B59,B60,B61,B64,B7,B70,B72,B75,B82,B83,B89,B9,B93,B97,C15,C16,C23,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C34,C36,C39,C4,C40,C41,C45,C46,C52,C53,C55,C58,C60,C61,C64,C66,C67,C69,C71,C74,C75,C79,C8,C80,C82,C84,C85,C87,C9,D2,D4,D5,D9
`Chr7:8281514`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	105	A1,A11,A13,A22,A23,A25,A9,B10,B105,B107,B109,B11,B113,B117,B118,B119,B120,B121,B128,B129,B132,B134,B136,B138,B14,B21,B22,B24,B26,B27,B3,B31,B32,B37,B4,B40,B41,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B52,B53,B54,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B69,B70,B71,B73,B77,B81,B84,B86,B88,B9,B91,B93,B97,B98,B99,C1,C11,C19,C20,C21,C24,C26,C28,C31,C32,C35,C36,C39,C40,C44,C49,C51,C52,C55,C56,C6,C62,C63,C65,C69,C74,C76,C77,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D11,D6,D7,D9
`Chr7:8281534`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	160	A1,A10,A11,A13,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A5,A8,A9,B1,B10,B105,B107,B109,B11,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B125,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B138,B139,B14,B16,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B4,B41,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B52,B53,B57,B59,B61,B62,B63,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B75,B78,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C19,C2,C20,C23,C26,C28,C29,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C65,C68,C69,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr7:8281535`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A11,A15,A16,A19,A3,A8,B10,B103,B105,B113,B120,B125,B13,B131,B134,B136,B14,B19,B20,B23,B29,B38,B39,B42,B43,B55,B60,B64,B7,B89,B9,C15,C16,C29,C30,C36,C39,C4,C41,C46,C52,C53,C58,C60,C61,C64,C66,C71,C80,C85,C87,D2,D5
`Chr7:8281551`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772840.1

183 aa

183

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 40-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772840.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	40	121	2.6e-23	82.5	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916857.1
TTGGAAAGTTCTGTTTTTTCTAAGTAGAACTGCAACTTATTCTACAAGCCAGTGTAGACAGCAAGCTCAAAATTCAGCCATTTTCGTTTATGCAACTTCAAGAAGATTTCACTATATATACCCCTCTCTCTGTACCATTCTTCATACCAGCTTCTTAAATTTGCAGTTTTAGTACTCAAATTAAGTAAAGCAAGAAATAGAAAGAGATGGATAGAGTCTCATTTTTTATGATTTATTGTGCTATTTTTGGCTTAGTTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992291
ATGGATAGAGTCTCATTTTTTATGATTTATTGTGCTATTTTTGGCTTAGTTGTTAACTTTGCAGCAGCACAAACTGTGCATGTAGTTGGAGATAGCATGGGATGGGATATTCCCCCAAATACTTCTGCCTCATATTCCAATTGGGCTTCTGCCAAAACATTCATGCTTGGCGACATCCTAGTGTTCAACTTCATGACTAACCAGCATGACGTAGTCCAAGTGCCCAAAGCCTCCTACGATGATTGCAGCGACGACGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772840.1
MDRVSFFMIYCAIFGLVVNFAAAQTVHVVGDSMGWDIPPNTSASYSNWASAKTFMLGDILVFNFMTNQHDVVQVPKASYDDCSDDGAIGSVITAGPANITLNSAGDRYYICTIGRHCEAGQKLSITVVSSSTPQPNACAPSPNAVAPMPPARLTPPPPPPSASVALPTSFLLLIISVGLALIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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