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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001296`

染色体: Chr07 坐标: 9950842-9955548 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001296`
名称	SmilChr07G001296
描述	uncharacterized SmilChr07G001296
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9950842 - 9955548 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992461`
GeneID	`130992461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992461`
原始查询	`SmilChr07G001296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Putative eukaryotic LigT [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820869]; symbol=AT3G16230; hit=AT3G16230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Putative eukaryotic LigT [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820869]; symbol=AT3G16230; hit=AT3G16230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G16230` (AT3G16230) Putative eukaryotic LigT [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820869] identity=48; qcov=1.01; evalue=9.53e-146; confidence=high
Rice	`Os01g0231900` - identity=44.3; qcov=0.921; evalue=8.2e-132; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006307 (DNA alkylation repair); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00013 (KH_1); PF10469 (AKAP7_NLS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057773081.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773081.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057773082.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057773082.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9951023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:9951115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:9951340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:9952144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:9953680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:9953714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B77,C62
`Chr7:9955409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C34,C48,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773081.1

540 aa

270

540

KH_1

AKAP7_NLS

PF00013 KH_1 148-207 aa PF10469 AKAP7_NLS 346-533 aa

XP_057773082.1

534 aa

267

534

KH_1

AKAP7_NLS

PF00013 KH_1 148-207 aa PF10469 AKAP7_NLS 350-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773081.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	148	207	1.9e-10	41.0	KH domain
`XP_057773081.1`	Pfam	`PF10469`	AKAP7_NLS	Domain	346	533	3e-53	181.5	AKAP7 2'5' RNA ligase-like domain
`XP_057773082.1`	Pfam	`PF00013`	KH_1	Domain	148	207	1.9e-10	41.1	KH domain
`XP_057773082.1`	Pfam	`PF10469`	AKAP7_NLS	Domain	350	527	2.9e-52	178.3	AKAP7 2'5' RNA ligase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917098.1
TGAATAAATGGGCTTATTGAAGCCCAATTATGTCCTTGGAATAATTATTTTGAAACGCAAAAATAAAACAAACTAATTTACCACCGTCGTCGCTACCGCCGCCGCCGGTTGTCGGGAAATGATAGCATGGAGGTCTCTGCTCAGATTGAACTTTCACGTTCGTGAAACTACAAACACTTATGCAAAATCGAAGCCCTTGCTGGACTTCCAGAAACCCAAGTTTTGGCATGGTTTTAGCTGTGAGTTGAATATGGATGCTA...

XM_057917099.1
GAATAAATGGGCTTATTGAAGCCCAATTATGTCCTTGGAATAATTATTTTGAAACGCAAAAATAAAACAAACTAATTTACCACCGTCGTCGCTACCGCCGCCGCCGGTTGTCGGGAAATGATAGCATGGAGGTCTCTGCTCAGATTGAACTTTCACGTTCGTGAAACTACAAACACTTATGCAAAATCGAAGCCCTTGCTGGACTTCCAGAAACCCAAGTTTTGGCATGGTTTTAGCTGTGAGTTGAATATGGATGCTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992461
ATGATAGCATGGAGGTCTCTGCTCAGATTGAACTTTCACGTTCGTGAAACTACAAACACTTATGCAAAATCGAAGCCCTTGCTGGACTTCCAGAAACCCAAGTTTTGGCATGGTTTTAGCTGTGAGTTGAATATGGATGCTAGAAATGGAAGGGGAAATGTGAATGATCGGAAAAAGCAAAAAAATGTCAGGCAAACATGGAGAGCAGTGTCTTCTCAGCCCGATTGCTCTGAGGGTGATGGTGAAAGTGTGATGGTACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773081.1
MIAWRSLLRLNFHVRETTNTYAKSKPLLDFQKPKFWHGFSCELNMDARNGRGNVNDRKKQKNVRQTWRAVSSQPDCSEGDGESVMVQNRQEEVCHGTSSTVSIAECGNSNIGVLDEPVGLDTGLVTEGGKIDESLHENFAPPKKHSLSVEIGASLMRFIKGKGGSTQEKIEVETGVKIIFPSSKKDDLIVLEGNSAESITQASEKIQTIIDKAVNSRELDYSHFVSLPLAIHPGLLDKLVNFQNTILRMTADDKDKNKDN...

XP_057773082.1
MIAWRSLLRLNFHVRETTNTYAKSKPLLDFQKPKFWHGFSCELNMDARNGRGNVNDRKKQKNVRQTWRAVSSQPDCSEGDGESVMVQNRQEEVCHGTSSTVSIAECGNSNIGVLDEPVGLDTGLVTEGGKIDESLHENFAPPKKHSLSVEIGASLMRFIKGKGGSTQEKIEVETGVKIIFPSSKKDDLIVLEGNSAESITQASEKIQTIIDKAVNSRELDYSHFVSLPLAIHPGLLDKLVNFQNTILRMTADDKDKNKDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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