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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001314`

染色体: Chr07 坐标: 10111616-10113982 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001314`
名称	SmilChr07G001314
描述	hydroxyphenylpyruvate reductase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10111616 - 10113982 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992480`
GeneID	`130992480`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992480`
原始查询	`SmilChr07G001314`

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文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`HPPR` P008; 2017	`AAZ67354`	`LOC130992480` `SmilChr07G001314` GeneID 130992480	protein; identity 97.764%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	DOI
`HPPR` P008; 2017	`DQ099741`	`LOC130992480` `SmilChr07G001314` GeneID 130992480	protein; identity 97.764%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	DOI

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功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyphenylpyruvate reductase
产物	hydroxyphenylpyruvate reductase
Arabidopsis	`AT1G79870` (AT1G79870) D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844326] identity=76.7; qcov=0.855; evalue=9.27e-174; confidence=high
Rice	`Os01g0228600` (OsHPR2-1) - identity=68.3; qcov=0.863; evalue=1.19e-160; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0016618 (hydroxypyruvate reductase [NAD(P)H] activity); GO:0030267 (glyoxylate reductase (NADPH) activity); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00960 (Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00389 (2-Hacid_dh); PF02826 (2-Hacid_dh_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992480

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057773114.1`
2	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773114.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057773114.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773114.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10111711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:10111785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B15,B50,B86
`Chr7:10111855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D7
`Chr7:10111866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C35
`Chr7:10111973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B15,B50,B86,C10
`Chr7:10112025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B15,B50,B86,C10
`Chr7:10113373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:10113472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C73
`Chr7:10113622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:10113625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:10113664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C73
`Chr7:10113760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773114.1

366 aa

183

366

2-Hacid_dh

2-Hacid_dh_C

PF00389 2-Hacid_dh 65-365 aa PF02826 2-Hacid_dh_C 162-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773114.1`	Pfam	`PF00389`	2-Hacid_dh	Domain	65	365	1.7e-24	86.7	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
`XP_057773114.1`	Pfam	`PF02826`	2-Hacid_dh_C	Domain	162	334	6.9e-54	182.6	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917131.1
AATTAATGATTGATTTAACCTAATCATTGTGAAACCAAACCACTAGTGTACAAAACCAGAGTCATTGACTCACGACGGCCGAAAAATGGTAGCCACAATCTGGCGCCGAGCCGCGCCGCATCTCAGCCGTGCATCACTTTCACGTGCTGCCTGCTCTATATTAACCAACCGCTCCCACAATTTCTCAACTACCACTCAAACACCATCTCCCTCCCCCGCCACCAACGCCGCCGCTGCCGCGAAAATGGAGGCGATCGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992480
ATGGTAGCCACAATCTGGCGCCGAGCCGCGCCGCATCTCAGCCGTGCATCACTTTCACGTGCTGCCTGCTCTATATTAACCAACCGCTCCCACAATTTCTCAACTACCACTCAAACACCATCTCCCTCCCCCGCCACCAACGCCGCCGCTGCCGCGAAAATGGAGGCGATCGGTGTTCTGATGATGTGCCCCATGAACAGCTACTTGGAGCAAGAGCTCGACAAGCGGTTCAAGCTCTTCCGCTACTGGACCCAGCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773114.1
MVATIWRRAAPHLSRASLSRAACSILTNRSHNFSTTTQTPSPSPATNAAAAAKMEAIGVLMMCPMNSYLEQELDKRFKLFRYWTQPKQREFLAQQAESIRAIVGNATYGADADIIDSLPKLEIVSSFSVGLDRIDLLQCKEKGIRVTNTPDVLTEDVADLAIGLMLAVLRRICECDKYVRSGAWKLGDFKLTTKFSGKRVGIIGLGRIGLAIAERAEAFDCPINYYSRSKKANTNYTYYGSVVELASNSDILVVACALTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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