当前解析结果
SmilChr07G001401| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001401 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001401 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001401 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10893295 - 10896148 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992686 |
|---|---|
| GeneID | 130992686 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992686 |
| 原始查询 | SmilChr07G001401 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | keratinocyte-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844071]; symbol=AT1G77350; hit=AT1G77350; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | keratinocyte-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844071]; symbol=AT1G77350; hit=AT1G77350; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G77350 (AT1G77350)keratinocyte-associated-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844071] identity=73.1; qcov=1.02; evalue=2.82e-56; confidence=high |
| Rice | Os05g0486200- identity=70.9; qcov=1; evalue=1.16e-47; confidence=medium |
| GO | GO:0042543 (GO:0042543) |
| KEGG | smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF09775 (Keratin_assoc) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992686 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057773420.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057773420.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057773420.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773420.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773420.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10894568 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr7:10895676 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B78,B82 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773420.1PF09775
Keratin_assoc 4-112 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773420.1 |
Pfam | PF09775 |
Keratin_assoc | Family | 4 | 112 | 5.8e-37 | 126.9 | Keratinocyte-associated protein 2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。