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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001717`

染色体: Chr07 坐标: 14590050-14593147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001717`
名称	SmilChr07G001717
描述	phospholipase A1 PLIP2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	14590050 - 14593147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995409`
GeneID	`130995409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995409`
原始查询	`SmilChr07G001717`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1 PLIP2, chloroplastic-like
产物	phospholipase A1 PLIP2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G02660` (AT1G02660) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839544] identity=53.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0253900` (P0705D01.7-1) - identity=56.3; qcov=0.697; evalue=9.7e-180; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057776663.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057776663.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057776663.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057776663.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:14590307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C41,C71,C74
`Chr7:14590318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:14590334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C51
`Chr7:14590785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:14591267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:14591270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:14591488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:14591721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B15,C10,C30
`Chr7:14592279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:14592310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C31
`Chr7:14592573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:14592614`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A10,A13,B126,B46,B67,B87,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776663.1

683 aa

342

683

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 344-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776663.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	344	481	8.8e-25	88.0	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920680.1
AGAAGTGCCCCAGCCCCTCCTTCCCTGCATAGCATAGACTCCAAAAATTCAAACACTGAGGTTTTACGTTGTTAGCATTCAACAACGCCCTTCGTCTATCTATATAACCATTCTCACGCACACACAATATATATCTAATCAATCGTATTCCGCAACTTGAGCAACTTTGATTTCCAGAACGAATTAGGCTTCTTGCGGATTCTCTTATGGCAATGGATGCTTTCTGTATCAAGGCAGGGATTCACGGAATCACAGCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995409
ATGGCAATGGATGCTTTCTGTATCAAGGCAGGGATTCACGGAATCACAGCGCCGCCGATCGACGCCACCGGGAATGTGGAGCTCCGTCTTAGTGCTGCGGCGGCGGAGGGGCCTTCTGCGTCGCCGAGGAATTTCCCTTGGGGCTTTACTTTCCGGCGGCCGCTGAGATCATTGTGGCCGGGGACCAAAATCCGGTTGGAATCAGCTATTGCGATGGACGACGCCGTTTTGGCGGAGAAGGATGATGTTGTGGAGAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776663.1
MAMDAFCIKAGIHGITAPPIDATGNVELRLSAAAAEGPSASPRNFPWGFTFRRPLRSLWPGTKIRLESAIAMDDAVLAEKDDVVESVDENWVSKVLRINSSRKGEEMRAKLEGKCGNYVKEEENFCAENEDCDVCAVDEDDGEKIEFDRESFSKLLRKVSLAESRLYAQLSYLGSLAYCIPQIKPGNLLRYNGFKLVTSSIEKKELALKIEKEKESASAAAEAENVESNETRQGIEAEAERNRVSSAAYQIAASAASYFH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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